ぎょーむ日誌 2003-03-01

2003 年 03 月 01 日 (土)

• 0800 起床． 朝飯． コーヒー．
• えーい， もう 3 月になってしまった …… しかし悪しき習慣と化しつつあるのか， 休日の朝はだらだらとすごしてしまう．
• しかしだらけてばかりもいられないので， メイル書きなど．
• 昼飯食ってから 1300 自宅発． 曇． 1310 研究室着．
• 樹木のサイズと種子生産量について， ちょっとだけ調べる． James Clark の種子散布モデル (1999) では， 幹の断面積に比例， としているな． その根拠となっている Eric Ribbens の論文 (1994) によると …… 離散値だけ調べる最尤法では dbh2 が一番よろしかった， と …… げ， また Pacala 先生とかが関与してるハナシだな， これは．
• 1420 北大構内走発． 今日は気温が高くあちこち水たまりあって走りにくい． 1500 研究室帰着．
• ひさしぶりに Matrix Population Models (Caswell, 2000) を見直して， 「生涯に残しうる種子数の期待値」 は純再生産率 (net reproductive rate) という名前だったと思い出す．
• で， Caswell 本ではこの純再生産率 (R₀ と表記) と individual fitness の関連について議論されており……
  • R₀ は個体に関する情報があればよいので 観測データから評価しやすい
  • 多くの研究では R₀ を適応度としている
  • Caswell は R₀ を適応度を構成する component と考える (ESS など調べたい場合には R₀ だけでは不可)
  • 動態モデルのパラメーターが時間変化する場合には，個体ベイス で R₀ を評価するのが良い
  まあ， こういうことに留意すればよろしいということのよーで．
• ついでながらその節の最後に， 生活史パラメーター間に trade off ごときものがある場合は， 個体ごとに推移行列つくれというようなことが． そりゃいったい何なのと， 引用されてる文献 (McGraw and Caswell, 1996) 調べてみる …… うーむ， どういうつもりなのか? 個体観測されたデータ (この論文では鳥の集団) から個体それぞれ生涯を行列で表現するのは， まだいいとして， だ． どうして，その固有値を相対化すると「適応度」になるわけ?
• 私は鳥個体たちのこういうデータあるんなら， もうちっとマシな確率論的モデルが構築できると判断する． 行列モデルでは個体の内部状態依存モデル (卵産んだら死にやすくなる，とか) がうまく表現できないための苦肉の策なのか?
• 一般講演 (ポスター発表) の準備とて， PipeTree の再計算に取り組む …… うん? なんか挙動不審だな， と思ったら， 自作汎用ライブラリにおける考えの足りない改造に原因が あったと判明． こういうところにつまずいて時間を浪費する．
• どうにかこうにか計算してくれるようになったので， とりあえず現状 (パラメーター設定) などを 再確認する試運転にかかる．
• 30 個体計算はとうぶんおわりそうにないので撤退． 2000 研究室発． 2010 帰宅． 体重 72.4kg．
• X における鍵盤設定． いつもやりかたをど忘れするなぁ …… 設定ファイル /etc/X11/XF86config-4 の keyboard 項において Option "XkbOptions" "ctrl:swapcaps" とすると， Ctrl と Caps Lock を入れ換えられる．
• 生態学会大会 に出発まであと 18 日 (うち 5 日は出張)．
• [今日の運動]
  • 北大構内走 1420-1500． ストレッチング．
• [今日の食卓]
  • 朝 (0920): パン． コーヒー．
  • 昼 (1230): チンゲンサイ・エリンギの焼きそば．
  • 晩 (2130): 米麦 0.7 合． チンゲンサイ・ブナシメジ・豆腐のカレー．