ぎょーむ日誌 2001-08-14

2001 年 08 月 14 日 (火)

• 0720 起床． 途中で一回ごそごそ起きたけど 合計 5 時間ぐらいは寝たかな．
• 朝飯・弁当の準備． 朝飯． シャワー．
• 0755 自宅発． 晴れ． ついに曇りの日々が終ってしまった． これからまた暑くなるんだろうか． 特急に乗って 0802 京急平和島発． 普通に乗り換えて 0830 京急上大岡発． 0845 研究所着． さすが 8 月． 日が照ると朝からぢりぢり暑い．
• 昨日の熱帯林で少しヘンな Kolmogorv-Smirnov 検定やってる甲山さんからメイル． そりゃあ， 生起確率ゼロの標本が得られれば 帰無仮説は必ず棄却されますよ． どんな検定法使っても．
• 確率論的モデルに誤差が混じってる場合は， なンか確率の複合分布 (compound distribution) 考えんといかんなぁ …… と前から考えてたんだけど， 具体的にはどうなるのかよくわからなかった． 今回つらつらと考えてみるに， あたかも誤差分布が中心的であるかのように 考えてみて， その平均値 m が別の分布 F(m) に従う， とすればいいんでないかなぁ …… などと思いついた．
• しかし， これって単に分布の平均が確率分布である， というモデルは想像しやすいだけのことで …… 逆に確率論的モデルの分布の全部のパラメーター を平均を含んだものに無理矢理翻訳して (というのも， たいていの確率分布はパラメーターを組み合わせると 平均になるんで …… しかし陰関数になることが多いか?)， そのあたりが何か誤差分布にしたがう， としてもかまわないわけだ．
• けっきょく， これって超パラメーターを考えるベイズ推定だよね． きっと． 超パラメーターの分布もデータから推定してみせる， というアレ． えーと empirical Baysian estimation， かな． ベイズな推定やったことないんで あまり確信もてないんだが ……
• 値段は数百万円するけど， いったい誰が使うのだろう …… という生態系変動領域 Sun Workstation で bash が使えるようになったので， ちょっとログインして， あちこちごそごそと覗いてみる …… ああ， Solaris ってやっぱ Linux とはだいぶ違うね． う? uname -a とすると SunOS 5.8 と出るな． いいのかな? よくわからん．
• ぢりぢりと危機的状況においこまれつつある PipeTree 改造に着手する． 何が危機的といって， これから大々的な改造しなければならないのである． なぜならいまの設計はかなりぼろぼろだから．
• そもそもパイプモデルというよくわからぬ 「原理」というか信仰にしたがって 樹木を作るようにしてるわけなんだけど …… だからといって 全体をこういう階層構造にする必要はないのである．

	森林 ┬ 樹木 ┬ パイプ ┬ 葉群	     ├ 樹木 ├ パイプ ├ パイプ断片	     │ 樹木 │ パイプ │ パイプ断片	     └ 樹木 └ パイプ └ パイプ断片

• いや， もしホントにそういう信仰だけに生きるのであるなら， これで教義どーりまことにけっこうなモデルである． ぢつは PipeTree プロジェクトは， まずはそこから始まった． しかしそういう狂気に染まってしまうのもイヤなんで (とはいえ，世の中には信仰への誓いによって 平和と思索の静かなる日々を実現してるヒトたちもいるらしい)， ケガれた観測データとの対応を考えねばならない．
• ということで， 1999 年秋 → 2000 年 11 月と PipeTree を 修繕を重ねていくうちに， 上の階層構造をみょーなカタチでまたがるような 構造が追加されていったのである． たとえば幹を形成する Pipe 断片だけをたばねた Trunk とか， Pipe 断片の位置情報だけを記憶している Skelton とか …… つまり上の図で示している世界の秩序は とっくに破綻しちゃってるわけだ．
• ではどうすればよいか? あとからいかなる宗教的解釈が付与されるにせよ， 樹木の地上より上に出てる 構造を生成するのに必要なクラスは， ふつーに考えるなら， たぶん以下のふたつだけであろう．
  • 樹状構造の伸長方向と分岐を決定する たくさんの「先端頂点」
  • 先端頂点が通過した場所を確保する 「断片」
  …… むろん， このほかにも葉群みたいなのも必要だろうし， あるいは LIGNUM の構造 に見られるような「分岐点」あるいは「節点」 (これらは断片と断片を接続してるもの) が必要になってくる場合もあるかもしれない (たとえば枝みたいな構造が時間とともに変形するような場合)． ともあれ， 樹状構造の基本的なホネぐみだけを生成 したいのであれば， 先端頂点と断片， もしくは先端頂点と節点の組み合わせでよい．
• パイプモデルでいう「パイプ」ごとき構造 (?) は 先端から根本の方向にむかって断片をたどるだけで (断片には極性がある)， パイプなる架空概念の形状は一意に決まってしまう． そしてこれにはとくに unique な機能があるわけでもない． ならば独立したクラスとして定義してやる価値はない．
• これまでの PipeTree の Pipe クラスは先端頂点と断片 (の一部) の 混じったものであった． これを「先端頂点」「断片」といった機能ごとに 独立したクラスとして分割しなければならない．
• と， 考えつつコードをどんどん削除していく． またあとでいろいろと書き足さんといかんのだろうけど．
• りすとらもあまり進んでないけど昼飯． とりあえず先端頂点だけの樹木でも作ってみるかなぁ．
• 午後も同じ作業． なんか撤退を繰り返してるようでいらいらするなぁ．
• べつにキレたわけではないけど， 削除に削除を重ねていたらこれだけが残った．

	森林 ┬	     ├
	     │
	     └

とほほ． さてさて， どうなるんだろうね．
• 新しいコードを書く気も失せたので， 甲山さん要求するところのオオシラビソシミュレイターの 満たすべき用件を整理してみる． いままでいただいたメモなど見直してみる．
• よくわからんのは先端部がどういうふうに死ぬか， 先端部に形成される断片の形状はどうなるか， というところだ． えーと， 生産したらすぐに針葉の呼吸をさっぴけ， か． もし， そういうことやったらどうなるんだろうか?
• 私がまだ九州大学の 4 年生やってたころに 書かれたメモの数値を信頼したふりをして そのあたりを計算してみる． 絶体絶命開空度 5.3%． ホントかね．

[葉っぱでの生産速度マイナス呼吸速度] 開空度が 5% あたりより低くなると (つまり暗くなると)， 稼ぎより消費のほうが多くなって死ぬ， という設定のようです． 甲山メモ 1991 年 (10 年モノですな) にあれこれと列挙されてる 信頼性よくわからぬ数値を組み合わせて概算． gnuplot script

(2001.09.05 後記: 上の計算と図はまったくの間違い )
• その他「当年生パイプの太さ-長さ関係はどうなってるんですか?」 うんぬんといった， 夏休み子供電話相談室ふう質問を列挙した メイルを北大に送る．
• BookPC 今日も安定してやがるな． やはり Buffalo の 128MB SDRAM の問題だったのかな …… でも 256MB 増設前は順調だったんだよね． 奇怪な．
• 甲山さんのアイデアについて 質問した以外の部分については理解できたんで (お望みどーりに動くかどうかはわからんけど)， ふたたびプログラムのほうにもどって考える． 何もかもきれいさっぱりと削除したあとは， 自由にアイデアが出るなぁ． さーて， どうしてくれよう．
• 新しいコード書きはやめといて， 帰宅することにする． 1740 研究所発． 普通に乗って 1755 京急杉田発． 特急に乗り換えて 1800 京急上大岡発． 1840 帰宅．
• 早くに帰ったので掃除機をかける． ダニ対策である．
• 旧科技庁系の健康保健組合に強制的に入らされてるんだけど …… 30 周年記念品とやらで 体脂肪計つき体重計なんぞ頼みもしないのに送って来やがった． うちにはもう体重計あるんだよね (最近乗ってないけど)． 未開封のまま Yahoo! オークションで売り飛ばそうかな． 希望小売価格を調べると …… なンと 16000 円． 保険料とりすぎてんぢゃないの?
• あ， 気象庁のサーヴァー， やられましたか ． 他もやられてるみたいね． お役所系はどこもまぬけだねぇ． 本格的な襲撃は 15 日か?
• 早くに帰ったので「ニセ」アカマツの続きでもやろう， と思ってるんだけど， どうにも眠い． 眠らずに起きてるだけ状態．
• とゆーことで， さっさと寝ますかね．
• 今日の食卓
  • 朝 (0730): 米 0.7 合． 鶏レバ・ピーマン・ニラ・ニンニク茎・エノキダケの 炒めものの残り．
  • 昼 (1220): 弁当． 米 0.7 合． ナス・タマネギ・ニンニク茎・ニラの野菜炒めの残り．
  • 晩 (2010): 米 0.7 合． 朝昼の残り． 残りものばかり食ってた一日であった．