ぎょーむ日誌 2001-01-04

2001 年 01 月 04 日 (木)

• 0700 起床． ねむ． 昨晩は早く寝ようとしたんだけど 0300 ごろまで寝つけなかった．
• 朝飯・弁当の準備． シャワー． ひげそり． 体重 71.8 Kg． ふーむ， 運動不足． 朝飯． コーヒー．
• 0755 自宅発． 晴れ． 冬の大森は太陽光発電が十分に可能な 光量が得られるなぁ (たしか気温高くないほうが発電効率良いはず)． 年末年始に蓄積した燃えるゴミを出す． とはいえ， 私の場合は一週間貯めてもスーパーでもらう袋 (中) 二つぶん弱にすぎないんだけど． 今朝は液晶ディスプレイを浜松町独房群に輸送． ただし計算機は ThinkPad だけなので そんなに重くない． 環七の首都高渋滞情報表示板． あれ， 今朝はがらがらだぞ． 0812 東京モノレイル流通センター発． 浜松町の気温 3 ℃． 0830 研究所着． Dennis さんと新年のあいさつを交わす．
• さっそく， 北大から計算機不調の質問メイル． えーと， 一般ユーザーで NFS 使えません． はい， それは /etc/fstab の NFS のところに user と書いて一般ユーザーでも使える 許可を与えましょう．
• BookPC と ThinkPad の間で rsync で同期をとる． えーと， つまりここでは BookPC と ThinkPad の間で， 自宅では Mate と ThinkPad の間で ディレクトリーの中身をそろえれば良いわけだ． ただし ssh が参照する host 名はちとややこしいことになっている． 現在の対応法だけ書いておくと， 自宅では闇経由で kubo-yami という名前の Mate 接続し， 浜松町では一度表ネット側にまわって kubo という 名前の BookPC に接続する． rsync を呼び出すシェルスクリプトを そろそろ改良せんといかんな (web site のディレクトリーに関しては <鳳翔> とも同期を取らんといかん)．
• 無線玉 (わいあれすとらっくぼーる) が絶不調なので (機械部を掃除してるんだけどポインターが なめらかには動かん)， 節を屈してマウスを BookPC を取り付ける． 非常に残念なことに， 現状ではこのマヌケな電気鼠のほうがはるかに使いやすい． うう． 無線玉に失地回復の余地はあるのか．
• 森林総研の柴田さんが昨年末に送ってくださった， 小川開空度測定地点の地図が届く． おお， こういう配置になっていたのか． なかなかにややこしいぞ．
• 1000 北大・地域生態でドクター取った西村さんが ここのアーキテクチャーグループのメンバーとして 浜松町に来られる． うーむ， ネクタイなんぞして まっとうな勤め人を偽装してますな． 区画は私の隣に． 書類書きに忙しそうである．
• おお …… なつかしの (元) 愛機 PowerBook540c 改まで 東京流刑地・浜松町独房群送りになったか． 私を追っかけてきてくれたのかしらん． 彼女の魅惑のグラビアとミステリアスなプロフィールは 明日のぎょーむ日誌に (予告)．
• 森林総研から送っていただいた開空度データに関して 小川モデリングメイリングリストに質問を投稿． 全天写真から計算された開空度が どれもこれも 10% 未満の小ささである． このあたりの面積補正に関する質問． しかし地平線に近い方向は重要ではないとは 思うんだけどなぁ． 空隙分布の元データとか無いんだろうか．
• E*cel → Text 変換された開空度データを解読する Perl スクリプトを書こうとしたんだが …… ちょっと中断． 今日送られてきた元ファイルの 部分的プリントアウトと比較するかぎり， E*cel の Text 変換ってかなりでたらめだと思う． インデントと有効ケタ数に関して． これは元ファイルがもう一度届くまで， しばらく待つことにするか ……
• 事務関係の変な E*cel ファイル一斉送信． うへー． まてまて， Gnumeric の試験運転に使えるぞ， これは …… うん， Gnumeric で問題なく開けているように見える．
• ま， 観測データ関係は元ファイルが届いてから 考えることにして， それまではけったいな推定系を もうちょっと単純化しよう． これは年末から取り組もうとしてるものの 進捗のない問題である．
• さすがに独房内だと他にやることがないので， 面倒な改良はぢりぢりと進んで行く．
• 一区切りついたんで， 昼飯にしよーか． え， 西村さんの PowerBook がネットにつながらない? なんとすでにこのドメインの IP は枯渇状態なのか， DHCP を指定されてますな． MacOS8.1 では DHCP がうまく設定できんのだろうか． ルーターも DNS サーヴァーも手動で切替えられんよーだ． 謎． とりあえず甲山さん用に確保されている IP アドレス 一個を使ってもらうことにすると …… うん， 固定アドレスだとうまくいくんだよね．
• 昼飯食ってから， また終わりの見えない改良に取り組む．
• 甲山さんからメイル． 春香山に山スキー に行って来たそうで， うらやましいかぎりです．
• 動態パラメーター推定のために シミュレイター動かすところで， 静的パラメーターファイル読まなくなる． 何がおこったのかよくわからんので， Filereader クラスのエラー処理を 改善してエラー発生位置を特定しやすくしてみる …… う． いきなり core 吐いた． Filereader 含む lib_basic.a 作り直したときは lib_evision.a のほうも直さんといかんのだった．
• エラー発生位置特定． なるほど， ダミーの mortality (各樹種) を食わさんといかんのに， そのファイルをこれまでのごちゃごちゃで破壊したから 動かなかったわけね． こういうことで動作がストップしないように 改善せんといかんかな． とりあえず以前の推定結果ファイルを ダミーとする． うん， まぁしばらくはこれで動かそう．
• 小川モデルのパラメーター推定系を単純化するために， 推定道具の mlfitting を高機能化せんといかん 事態に追い込まれる． つまりいままで mlfitting の入力値として double しか受けつけてなかったのを string も食わせるような設計にしないといけない． しかしただでさえ遅い mortality 推定を これ以上遅くするわけにもいかんので， string-string 比較をやらせてはダメ． ということで， パラメーターファイルの中で マクロ展開というか，

	STRING  Alive           0
	STRING  Breakage        1
	STRING  Together        1
	STRING  Withered        1

とゆーふうに 「データーファイル読み込み中に Alive を見つけたら 0 に置き換えなさい」 なる指示を書くのである (さらにこの整数を 必要もないのにわざわざ浮動小数にするんだから ますますアホらしい)．
• あー， 早く mlfitting は捨ててしまいたい． これまでの反省点多数を反映させた 高速汎用最尤推定プログラム mlest を作ろうと 計画してるんだけど， これまたいったいいつのことになるのやら． もはや mlfitting に新機能は 付けないつもりだったのに， ますますわけのわからぬ機能拡張が 繰り返されている．
• 何とか最小限の改造で上のような機能を追加してみる． まさにコードをもぐり込ませる …… とでも表現したくなるような． こういう作法はダメなんです．
• う． データーファイル読み込んでくれん …… あ， ひょっとして状態を表すコードは もっと複雑だったかナ ……

	  56632	Alive
	    392	Alive?
	     40	Alive?_Recruitment
	   1336	Alive_Recruitment
	    240	Breakage
	      4	Breakage_Recruitment
	    152	Together
	      8	Together_Recruitment
	    924	Withered
	      8	Withered_Recruitment

うーん， こんなにややこしかったか． しかし良く見ると ? だの _ だのの後ろを捨てれば良い． しかし mlfitting は便利なケガれ言語 Perl ではなく 正規表現の苦手な呪われ言語 C++ で書かれているのである．
• しょうがないんで， またしても温泉旅館無秩序拡張工事的に chop なる関数を新しく作り， 指定した全てのトークンの後ろの文字列は 抹消するようにしてみた．
• ふう． 死亡率推定に関しては多少は改善された． しかし， まだ成長率のソレが残されてるな． 新規加入率? 考えたくない． どうせ新規加入などは当分ほうっておいてよいのだ．
• 一区切りついたんで帰宅することに． 西村さんは独房生活一日目から 多忙にしておられるようである． 1755 研究所発． 1812 東京モノレイル浜松町発． 1845 帰宅．
• 晩飯食いながらラジオのニュース聞く． 新潟がぐらぐら揺れてるようである． 伊豆諸島の次は日本海側か． 次は関東平野か． なんか近ごろあちこちでまた揺れてるような気がする． 東京流刑地は頻度少ないけど， かえってブキミだ ……
• 晩飯食ったらもーれつに眠くなる． 睡魔には負けませんでした． しかし 2 時間を空費． なーにやってんだか． しかも夜になってコーヒー飲んでしまって …… うう， いきなり眠気がトんでしまった． 危険だ．
• 今日の朗読
  ``Analytical Population Dynamics'' (Royama, 1992)
  PartII Analysis of classic cases
  Chapter 6 Snowshoe hare demography
  • 6.1 Introduciton
  • 6.2 Evidence for the 10-year cycle
  • 6.3 Annual changes in demographic parameters
  • 6.4 Ecological process determining natality
    • 6.4.1 Dependence of natality on relative body-weight changes during winter
    • 6.4.2 Pregrancy rate and litter size
    • 6.4.3 Effect of overwintering condition on litter size in summer
    • 6.4.4 Effect of overwintering contidion on pregrancy rate in summer
• この章から前章ヤマネコのエサたる カンジキウサギが増えたり減ったりという 話になるんだが …… これはあたかも， 昨日の 「動物個体群調べるヒトはたいへんですなぁ」 という私の同情とも揶揄ともつかぬ感想に対する 動物なヒトたちの反撃のようである． ヤマネコなどよりはるかに詳細に調査可能な対象である ウサギをこれでもかこれでもかと偏執的に調べあげ， 妊娠率は何で決まるかリターサイズは何に依存するんだ と解明していくのである． これらのモデリングは `Rochester 研究' `Yukon 研究' と呼ばれる じつに執念深い別々のウサギ調査プロジェクトに 基づいているのである． そのしつこさあきらめの悪さ恐るべし． そして， こーいう細かいコトの積み重ねで ついには北米大陸北部のありとあらゆる 動物個体群に見られる「10 年周期振動」を まとめて説明してやるぜい， もの静かな著者の密かな野望が この章の冒頭で語られたりしているのである． 野外動物個体群生態学とはこれだ ! というかんぢでしょうか．
• メイルなど書いているとすでに 2400． コーヒー効きすぎで眠気なし． 神よ．
• 今日の食卓
  • 朝 (0720): 米 0.6 合． 昨日の味噌汁に豆腐と冷や飯投入した雑炊．
  • 昼 (1220): 弁当． 米 0.8 合． 豆腐とニンニクの茎の炒めもの．
  • 晩 (1910): 米 0.6 合． 朝の雑炊の残り．