ぎょーむ日誌 2018-12-(01-10)

2018 年 12 月 01 日 (土)

• 0600 起床．
  • RT @hankagosa : 本日のRubin先生の講演のスライドのURLを教えてもらいました。 twitter.com/tetsuroito/sta…   10:47:32
  • 麺類好きぼーい先生、昼ごはんに幌加内（ほろかない）蕎麦作ったら…あっというまに袋半分たべて、わたしの蕎麦も強奪… pic.twitter.com/c2V4MZ5q1I   11:36:39
  • 
  • 紀伊国屋書店札幌本店、ぼーい先生とうろうろ… pic.twitter.com/LUnRrbhimW   15:43:32
  • 
  • RT @heavywatal : RでRコンパイラを書く、熱い！ github.com/igjit/nrc #japanr   17:27:22
  • …という，ご感想いただいたのですが…「あ，そうなのかな？」という気もする一方で，そんなに乖離してるのかな，とも．ひょっとして，久保ではなく伊庭さんのことかな…と補外してみたのだが…うーむ？ twitter.com/hirokiaramaki/…   22:52:43
  • RT @ishiiakira : 実現性は低いが成功すれば大きな成果が期待できる「ムーンショット型」と呼ばれる野心的な研究を対象に１千億円を計上するとして、それを２万人に500万円ずつ広く配れば、間違いなく大当たりの研究が１つか２つは出て来ると思います。 twitter.com/konamih/status…   23:15:32
  • RT @jun_makino : 引用:政府は実現性は低いが成功すれば大きな成果が期待できる「ムーンショット型」と呼ばれる野心的な研究を後押しする。2018年度の第2次補正予算案に1千億円規模を盛り込む方向で検討に入った。産業や社会を一変させる可能性のある大胆な研究を推進し、将来の成長につなげる狙い。   23:16:01

2018 年 12 月 02 日 (日)

• 0600 起床．
  • ぼーい先生「みゅんへん、いきたい‼︎」とのことで、札幌・大通公園のミュンヘン・クリスマス市に… pic.twitter.com/mpOYaAu77H   13:51:23
  • 
  • 札幌・大通公園のミュンヘンフェスティバルで買ったのは…ソーセイジやノンアルコール小樽ビールなどなど… pic.twitter.com/HPkeL7Ve7z   14:35:35
  • 
  • 検定力分析と効果量 rtokei.tech/memo/%e6%a4%9c…   18:36:56
  • RT @tetsuroito : Rubin先生のスライドアップされてるな   20:47:29

2018 年 12 月 03 日 (月)

• 0600 起床．
  • RT @sinzan_yukoku : JTは民営化された一般企業だと思っている日本国民は多いと思うが、それは違う。 JTの筆頭株主は財務大臣で、たばこ事業法に守られた国策会社。 つまり、海外では、JTのしていることは「日本株式会社」の所業であり、日本国民が支えているとみなされている。 ニコチン依存ビジネスと、搾取産業にNOを！ twitter.com/happylife0951/…   09:40:25
  • RT @EzoeRyou : 本の虫: 三十路を超えたので体について考える cpplover.blogspot.com/2018/12/blog-p…   09:44:31
  • RT @daiti_m : David MacKayの "Information Theory, Inference, and Learning Algorithms" にAmazonで書評が1つしかなかったので、レビューを書きました。個人的には、PRML以上に素晴らしい教科書だと思っています。 www.amazon.co.jp/dp/0521642981/   11:45:23
  • 一週間ほど前，南米の森林にすむクビワペッカリー とベアードバクの「24 時間」という「資源」を二種がどうわけあっているのか（あるいはそうしてないのか）を調べるデータ解析の論文がある…などと紹介してみましたが，なぜディリクリ過程が必要なの…というのはまったく「わかってなかった」ので… twitter.com/KuboBook/statu…   12:27:20
  • rdcu.be/bb4Aw この論文では南米の森にすむ動物２種「うろうろ」時間帯が同調してるのかしてないのか…を調べる研究．生態学ではディリクレ過程の利用は珍しいのですが…ここでは，DP な 24 時間周期変化モデルを作り，両者の活動の相関が同調する時間を推定…まあ生態学もこんなかんじで… pic.twitter.com/P9847g0RFU   12:33:40
  • 
  • RT @juntnk : 昨日、こんな本を買いました。講談社ブルーバックスの新刊「独楽の科学」山崎詩郎著。別名コマ博士。 「物理学者にしてコマの世界大会に出場」という肩書きがいい（笑） 内容もわかりやすい！さすがコマ博士！ 今度サインしてもらおう。 pic.twitter.com/p1aMoGD4kx   17:02:15

2018 年 12 月 04 日 (火)

• 0600 起床．
  • RT @hankagosa : Hastie先生、Tibshirani先生、信じてたのに… 僕に信頼区間警察をやらせないでくれ！！👮‍♂️ pic.twitter.com/BAin6upWC3   12:39:57
  • RT @Kyukimasa : 火星の地層から「暗い太陽のパラドックス」の解明へ www.sciencemag.org/news/2018/12/d… 数十億年前の太陽は2割ほど光が少なかった(全球凍結で生物が死に絶えなかった謎)。光量に影響する太陽の質量損失率を地球上の地質学研究で推測するのは難しいけど、火星では地層残ってて年代変化分かるのだとか   13:23:29
  • はい，Journal of Statistical Software 新刊 www.jstatsoft.org/issue/view/v087 …えーと，MatLab の状態空間モデルSSpace ？…JSS, R でなくても OK なんだ…お，SAS とか Stata も…おっと，書評欄では bookdown 本をとりあげていますね． pic.twitter.com/4lW3PfWcAN   13:46:19
  • 
  • 蛇足ながら Journal of Statistical Software (JSS) は無料で，だれでも読めます（たぶん） www.jstatsoft.org/issue/archive   13:50:39
  • StanCon 2018 Helsinki talk slides, notebooks and code online - Statistical Modeling, Causal Inference, and Social Science andrewgelman.com/2018/12/03/sta… 今年の StanCon (ヘルシンキ）の資料があれこれ公開されていますね…   14:12:59
  • RT @SOKENDAI_ESB : 【 #プレスリリース 】沓掛展之 講師らの共同研究『繁殖していないペアほど息の合ったダンスを踊る：タンチョウから定説を覆す発見』が公開されました。 この研究は、 #タンチョウ のつがいが踊るダンスの役割を示した世界で初めての研究です。　 #ツル 　 #行動学 　 #繁殖 www.soken.ac.jp/news/5977/   14:18:45
  • カルチャーラジオ 日曜カルチャー 「やさしい“ブラックホール”入門」（1）全4回 - NHK 【ブラックホールが黒いわけ】筑波大学計算科学研究センター教授…大須賀健 www4.nhk.or.jp/P1940/x/2018-1…   16:54:35
  • RT @endBooks : 「やさしい“ブラックホール”入門」💫🌌 【全4回　各1時間音声】 筑波大学計算科学研究センター教授：大須賀健 nhk.jp/radio/?p=1940_01 カルチャーラジオ📻NHKラジオ #radiru pic.twitter.com/BBJClE8pzS   16:55:37
  • RT @Atsushi776 : 誤差バーをつけると途端にそこに真値があると思ってしまうのは人間の性か？   17:05:03
  • RT @MethodsEcolEvol : New convenient methods of #Species distribution modelling ( #SDM ) using #Gaussian processes bit.ly/StatEcol07 #ISEC2016 #Ecology #Stats   17:14:00
  • MEE (Methods in Ecology and Evolution) という生態学・遺伝学なモデリングのジャーナル…ガウス過程を研究に使えますよ…論文． Fast and flexible Bayesian species distribution modelling using Gaussian processes. Golding 2016 - Methods in Ecology and Evolution besjournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.11… pic.twitter.com/mEWLyXHzG7   17:23:32
  • 
  • Ecology and Evolution の訳は「生態学と進化生物学」…かな…遺伝学は進化生物学の一部に含まれるといいますか…よくわかりませんね． pic.twitter.com/vTzlCj2ezg   17:28:54
  • 

2018 年 12 月 05 日 (水)

• 0600 起床．
  • RT @okasanman : 日本の核燃料サイクル完全崩壊へ、フランスが高速炉実証炉「ASTRID」の開発を凍結(BUZZAP!) buzzap.jp/news/20181129-… pic.twitter.com/Sn1Fx2CC9P   09:56:28
  • RT @tomatoha831 : 欧米の重力波検出器LIGO-Virgoが過去の観測データの結果を公表し、新たに4つのブラックホール同士の合体を発表しました！左の図はブラックホールの質量やスピンの分布を表していて、右の図は人類の観測によって明らかになったブラックホールや中性子星の質量の分布や進化の様子が描かれています！ pic.twitter.com/ZFQ6hYnjVk   11:58:43
  • R の library(nimble) r-nimble.org/bayesian-nonpa… …のカーネル密度推定の紹介．ディリクリ過程混合モデルの指定と事後分布推定． pic.twitter.com/MJk5GCHpAf   13:06:10
  • 
  • 「Pythonによるベイズ統計モデリング: PyMCでのデータ分析実践ガイド」の「第 7 章 混合モデル」「第 8 章 ガウス過程」それぞれで，ディリクリ過程とガウス過程についての「数式はやや少なめ」な説明があります．下の図は Wikipedia en.wikipedia.org/wiki/Gaussian_… から引用． pic.twitter.com/itbFNDwGRZ   13:51:22
  • 
  • ベイズモデルを表現する，この楽しい図は発案者の名前をとって Kruschke (style) diagram とよばれているようで… Kruschke さんは，いわゆる「イヌ 4 匹本」(Doing Bayesian Data Analysis) の著者．ダイアグラムの「てんぷれ」は Rasmus Bååth さんの github にあり github.com/rasmusab/distr… pic.twitter.com/vJEgWNN5GN   14:51:18
  • 
  • Kruchke ダイアグラムの部品 github は github.com/rasmusab/distr… ですが，LibreOffice Draw 版ならびに LaTeX 版もあり，ダウンロードできます → www.sumsar.net/blog/2013/10/d…   15:04:23
  • Kruchke ダイアグラムは「上」→「下」に流れますね．私がベイズモデル図を描くとこんなかんじに…「上下逆でしょ」と指摘されるのですが…統計モデルについて考えていると，得体のしれない村上春樹的な「地下２階」があり，それが地上ににじんでくる…というような… cf. ameblo.jp/chitosecom/ent… pic.twitter.com/SoZP6kSPJa   15:20:11
  • 
  • Ubuntu Weekly Recipe：第548回　書籍制作を支援するソフトウェア「Re:VIEW」を使う #gihyojp bit.ly/2PjfHQz   15:51:34

2018 年 12 月 06 日 (木)

• 0600 起床．
  • おはようございます。なぜか、新十津川からきた「ヤーコン」に取り組んでいます… pic.twitter.com/g4eUIP7m9i   06:30:32
  • 
  • "番外編　グラスホッパー (1) - シンパパ孤立むえん！ " alone-and-unaided.blog.jp/archives/27245… 映画 CG 分野でご活躍のシン（グル）パパの青春期…まずはポリゴン数 15 から…   09:54:37
  • RT @MrUnadon : 【Stan Advent Calendar 2018, 6日目】 RとStanで多クラスのベイズ多層ニューラルネットワークを実践し、その有用性や振る舞いについて検討。ベイズで畳込みニューラルネットにも挑戦。ちゃんとした解説は場所を改めて執筆します。 MCMC(*´Д`)ﾊｧﾊｧ Enjoy! Stan!! qiita.com/advent-calenda… pic.twitter.com/mNgyeMHPST   10:16:22
  • RT @simizu706 : tidyverseが流行ってるなか、applyとplot派の僕があえてtydyverseを使わずにMCMCの結果をまとめるとこんなのになるよ、という記事を書きました。Stan advent calendar 4日目の記事です。 norimune.net/3138   10:16:48
  • はい，また「やらかし」ました．「第 7 章 混合モデル」ではディリクレ分布は登場しますが，ディリクレ過程の説明はありません…いやはや…ここで説明されているのは，ガウス混合モデル (Gaussian mixture model) でした！すみません… github.com/aloctavodia/BA… pic.twitter.com/jsjCa15Dib   13:15:36
  • 
  • Bayesian Analysis with Python: Introduction to statistical modeling and probabilistic programming using PyMC3 の第２版はこれ www.amazon.co.jp/Bayesian-Analy… いまのところ，紙版はない．   13:21:53
  • RT @sorae_jp : スペースX「ファルコン9」ロケットの再々使用に成功 - by sorae is.gd/ro7WXq pic.twitter.com/GgjTNrN9C8   13:29:42
  • 「ファルコン9」着陸失敗し海上落下　補給船は打ち上げ成功 | sorae：宇宙へのポータルサイト sorae.info/030201/2018_12… "「ドラゴン補給船」の軌道投入には成功したものの、ロケット第1段の着陸には失敗しています"   13:32:33
  • RT @mainichi : 外国人技能実習生は、2015〜17年の3年間に69人が死亡していました。うち12人が実習中の事故で、6人が自殺し殺害された人も4人いました。立憲民主の長妻昭氏が法務省資料を入手、 #政治プレミア への寄稿で明らかにしました。 mainichi.jp/articles/20181…   15:51:27

2018 年 12 月 07 日 (金)

• 0600 起床．
  • RT @simizu706 : Stan advent calendar 2018　7日目の記事です。 「Stanを使ってRにNUTSを実装する」、という記事を書きました。ネタ記事に見えて、StanのMCMCのアルゴリズムについて解説しています。 norimune.net/3149   09:18:10
  • 京都市左京区南禅寺草川町に「琵琶湖疏水記念館」というのができていたのか…（1980 年代末？） biwakososui-museum.jp/museum/ pic.twitter.com/KR5RAVY0mp   10:29:57
  • 
  • RT @tabi_saito : びわ湖疏水船に乗った。大津市三井寺から京都市蹴上まで、明治23年（128年前）に建設された真っ暗な水路トンネルを船で下る。琵琶湖疏水の観光船は今年67年振りの復活だそう。最高かよ pic.twitter.com/1bbJFPsek9   10:32:42
  • とつせんの吹雪にとざされる札幌市… pic.twitter.com/AVhzEWT3Kn   13:52:40
  • 
  • Wikipedia の項目「セブン・セカンド・サミット」 ja.wikipedia.org/wiki/%E3%82%BB… "地球上にある7つの各大陸（厳密には大州）で2番目に標高が高い山の総称" "セブン・セカンド・サミットの登頂は、多くの登山家や地理学者によって、七大陸最高峰よりもはるかに困難であると考えられている" pic.twitter.com/V0oun5NoSu   15:10:58
  • 
  • 文化庁 ってナゾの啓蒙してるな… www.bunka.go.jp/pr/publish/bun…   20:47:13

2018 年 12 月 08 日 (土)

• 0600 起床．
  • 除雪にとりくむ… pic.twitter.com/oVVjM8Yimg   09:46:08
  • 
  • ぼーい先生と氷点下の雪上散歩 pic.twitter.com/ePaOuVQpCV   14:41:09
  • 
  • Bayesian Nonparametric Models in NIMBLE, Part 2: Nonparametric Random Effects r-nimble.org/bayesian-nonpa…   15:22:40

2018 年 12 月 09 日 (日)

• 0600 起床．
  • 今日もぼーい先生と氷点下散歩。気温マイナス5℃、風速 5 メートルぐらいの、広大な北大農場を踏破して、なんとか研究室にたどりつきました… pic.twitter.com/A1lAcHiRWH   13:05:46
  • 
  • RT @masa_skny : 無駄な仕事をさせられたメーカーの人々も辛かったろうな。しかし、整備って整備専業の会社がやるイメージあるし「整備だけするのはリスクが高く～」ってほんと？ / 東京新聞:＜税を追う＞Ｆ３５Ａ国内企業参画中止　産業育成　絵に描いた餅:社会(TOKYO Web) www.tokyo-np.co.jp/article/nation…   13:50:01
  • RT @Emil_Hvitfeldt : Day 7 of #packagecalendar is… 🔊🔦 gghighlight Giving some data extra emphasis during data visualizations can be tricky at best. The amazing gghighlight package lets you highlight using intuitive syntax and simple functions github.com/yutannihilatio… #rstats pic.twitter.com/Zihh3QmMee   13:52:33
  • RT @hankagosa : ブログ更新しました → TensorFlowで統計モデリング - StatModeling Memorandum statmodeling.hatenablog.com/entry/statisti…   16:08:34
  • RT @u_ribo : 自分の資料も公開。念願の統数研Rユーザ集会デビュー💪 （LTだけど💦）現状ベターな方法であろうDocker環境の成熟、どこまでを"reproducible"に求めるが難しいと感じる一年でした。 紹介する例はRだけど、データ分析で使う言語全般に当てはまる課題だと思います。 #rjpusers speakerdeck.com/s_uryu/improve…   21:41:15

2018 年 12 月 10 日 (月)

• 0600 起床．
  • RT @M123Takahashi : Rの<-と=は、両方とも付値を行う演算子ですが、違いはあります。<-は一般的に付値を行いますが、=はトップレベルでしか付値を行えず、以下のように関数の中では付値できません。 mean(x<-rnorm(100)) x mean(y=rnorm(100)) y よって、Rコミュニティでは付値の演算子として=よりも<-が推奨されます。 twitter.com/taberuhanasu/s…   09:10:56
  • crond 停止は /etc/rc.d/init.d/crond stop もしくは service crond stop 560days.com/lab/2012/06/00…   15:28:30
  • crontab -e で「例のヘンてこな spamassassin local.cf の強制かきかえ」を停止．sudo /etc/init.d/crond start (何のジョブもないが) （参考） eng-entrance.com/linux-command-…   15:32:00
  • これをもって今年最後の「生態学会さーば雑用」おさめにしたい…   15:33:03
  • 村上さん，休憩はあるにしろ「10時～17時」の長丁場ですか… twitter.com/tousuuken/stat…   16:05:29