ぎょーむ日誌 2017-04-(01-10)

2017 年 04 月 01 日 (土)

• 0600 起床． 余市ふらふら …… いまだに，ちょっと風邪ぎみ ……

2017 年 04 月 02 日 (日)

• 0600 起床． 朝飯の準備その他ばたばた．
  • Running Stan with external C code andrewgelman.com/2017/03/31/run… Stan 2.13 から C++ 拡張がさらに容易になった…ということのようで…   05:51:19
  • spatsurv: An R Package for Bayesian Inference with Spatial Survival Models www.jstatsoft.org/article/view/v… 空間構造を考慮した生存解析モデル，Bayes&MCMC pic.twitter.com/ecy23oENu8   05:56:57
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  • RT @willyoes : 滋賀大に続いて横浜市立大も来年度データサイエンス学部新設。医学部があるから滋賀大よりシナジーが期待できる。 www.city.yokohama.lg.jp/shikai/pdf/sir…   07:05:44
  • RT @ibaibabaibai : なんでベイズ生存時間分析というとパラメトリックなのばっかりなのかなぁ． twitter.com/KuboBook/statu…   09:12:03
  • RT @ibaibabaibai : これは久保本も大い問題ありだけど、「モデル」「あてはめの原理」「あてはめを実装する計算法」を混同するのはいい加減にやめたほうが。ＧＬＭはモデル、ベイズや最尤法はあてはめの原理、ＭＣＭＣは計算法。   09:14:24
  • RT @ibaibabaibai : 久保本に言ってることは、端的にいえば、初心者に最小二乗法とかランダム効果モデルとか教える必要なし、最初から最尤法、階層ベイズモデルでいいじゃない、ということだと思うよ。概念がウリというのはそういうこと。ただ計算法は別で、なんでもＭＣＭＣでやる人がいたらそれはアホ。   09:14:27
  • 道央圏北端の石狩市厚田区。漁港と海岸段丘と雪山と空。 pic.twitter.com/or0f8KtB3N   15:30:42
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  • 石狩市の花畔（←ばんなぐろ、難読地名）の徳光コーヒー。ひさしぶりに、おいしいエスプレッソ・ドッピオを飲めて、まんぞく… pic.twitter.com/sB2WuXMjc7   16:32:55
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  • 徳光コーヒーのサイトはこちら→ tokumitsu-coffee.com   16:41:02
• 2140 とら寝かしつけ …… してるうちに自分も寝てしまった ……

2017 年 04 月 03 日 (月)

• 0600 起床． 朝飯の準備その他ばたばた． 0820 保育園着． 0850 研究室着．
  • 民営化30年の明暗、ＪＲ北海道とＪＲ四国の苦境｜冷泉彰彦 www.newsweekjapan.jp/reizei/2017/03… "若者が進学や雇用の関係で全道から札幌に集まって…引退した高齢者が医療体制の完備された札幌圏に…全道540万人の人口のうち、64％が札幌市に集中…人の流れも札幌圏で完結"   11:25:36
  • ＦＤＡ　丘珠―静岡線　２６日から再開　運航増　毎日１往復 dd.hokkaido-np.co.jp/news/area/sapp… pic.twitter.com/qpqPdNy6AX   11:56:49
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  • RT @MrUnadon : RでTable。コードをまとめました。数千行のデータセット・膨大なStanの結果などはformattable()で秒殺の視覚化。目で見て確認して、データ操作時の脳の負荷をrm(list=ls()) mrunadon.github.io/TableWithR/ pic.twitter.com/MF3JBsla9m   14:57:23
  • RT @Satoru_Wada : Google mapsのパックマン、札幌は道路が単純すぎてつまらないという声を聞きます。中央区の東本願寺や医大の付近は変化があっていいかもしれません。 pic.twitter.com/a0uclZFYou   16:45:20
• 1750 保育園着． 2130 とら寝かしつけ …… またともだおれ ……

2017 年 04 月 04 日 (火)

• 0600 起床． 朝飯の準備その他ばたばた． 0840 保育園着． 0910 研究室着．
  • RT @Micky_Takeuchi : 「天の川銀河研究理工学センター」!!　10年以上前でしょうか、PAONET（公開天文台ネットワーク）のミーティングのときの雑談で、まだ鹿児島大に行く前の半田先生が「『銀河系』というのはおかしい、『天の川銀河』と呼ぶべき！」と力説されていたのが思い出されます。 twitter.com/agata_naoj/sta…   09:50:09
  • どうも今日は朝から生態学会さーばあれこれ不調気味．以前にくらべれば不正アクセスは減っていて（iptables で DROP してるから）リソースをどか食いする mailman もときどき再起動するように設定しているんだけど… pic.twitter.com/5rlLBDYRfH   11:17:13
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  • RT @Jinja_Kikou_Net : 【宗谷】 平成29年4月1日「宗谷」リニューアル。 せっかくなので翌2日にお色直しした宗谷に会いに。 南極観測船として著名ですが実は帝國海軍横須賀鎮守府（横鎮）所属艦歴もある特務艦でもあり。 「帝国海軍最後の生き残り」 そんな側面から見てみしょう。 それではいざ参ります。 pic.twitter.com/gd2Yd7KvJD   14:14:14
  • 生態学会さーばー…どうにもメモリ浪費ぎみなので… top をながめつつ，いったん Anti-virus (なのか?) の Dr.Web を切る．WatchDog の監視も解除する必要あり…はてさて… pic.twitter.com/UQO4MbJHBz   15:21:10
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  • RT @BIJapan : アメリカにあふれる「墓場」のようなショッピングモール dlvr.it/Nnb4r9 pic.twitter.com/yPmpR7MNc6   15:33:08
  • 毎朝、コーヒーを「ぼろぼろ」ボトルに入れて出動するのだが…わりとすぐにコーヒーの味が悪くなるような…ボトル内で空気と混交して酸化するのが原因…なのかな？ pic.twitter.com/GaGAiIDN9g   15:44:49
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  • 生態学会さーばー…そのものではなく，その上で動作する WordPress の動作がいまいちで，こういうことに時間を収奪されてるかんじ…えーい，このマルチサイトってどうしてこうとらぶるが… wpdocs.osdn.jp/%E3%83%9E%E3%8…   15:47:54
  • 北大構内を走って保育園に急行中…とゆー実況を企図したのだが…急いでいたのでボツ案件に。いまは帰宅して「カレーマカロニ」なるふうがわりな料理を作成してぼーい先生と賞味したところ。パスタとカレーなので、まあハズレなし（4歳児的には）… pic.twitter.com/Q84gmNVId7   19:21:50
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• 1750 保育園着． 2140 とら寝かしつけ …… どうして，いつもこの時刻になってしまうのだろうか ……

2017 年 04 月 05 日 (水)

• 0600 起床． 朝飯の準備その他ばたばた． 0835 保育園着． 0910 研究室着．
  • RT @Simon_Sin : 「コアラはユーカリしか食べないがユーカリには毒がある。だからコアラはユーカリの葉を体内で発酵させて毒素を取り除いて消化しているがそもそもユーカリには栄養分がそれほどないのでコアラはほとんど動かない」コアラが今まで絶滅してないのが不思議なレベル #daycatch   09:17:57
  • 日本の科学研究はなぜ大失速したか (中野徹） gendai.ismedia.jp/articles/-/51370 "研究費が足らないから競争力がなくなった、ということに全く異論はない。しかし、そのことは必ずしも、研究費を増額したら競争力が蘇る、ということを意味しないのだ"   11:21:43
  • 学会さーば「もうやだ」ぎょーむメモ…WordPress マルチサイトは呪われぎみ…試行錯誤で発見した彌縫策 RewriteRule ^([_0-9a-zA-Z-]+/)?(files.*) wp-content/blogs.dir/7/$2 [L] …dir 以下は汎用性なし！   13:25:12
  • 学会さーば「もうやだ」ぎょーむのど忘れ防止メモ…前述 RewriteRule は動的な「その場しのぎ」，次の大会はこれでなんとかなりそうだが，さらにその次でを考えると…「次」の更新が終わったら，静的サイト生成のプラグインみたいなのを使えばよい？…えーい，めんどくさい…   13:30:59
  • RT @ibaibabaibai : 偉い人たちが「小手先だけの改革でなく本気の改革」をすれば日本の学術研究の崩壊が救えるってTW・RTしてるけど，小手先の改革でここまでひどくなったんだから，本気で改革したら壊滅するとは思わないんでしょうか．データがあるのに実質その反対のこと言われても．   13:32:21
  • RT @monogragh : たった一人の教授が323本の論文を書き、自分の創刊した雑誌に掲載し、自分の論文を頻繁に引用することで、大学ランキングが大幅上昇したアレクサンドリア大学の事例が紹介。 www.amazon.co.jp/dp/4472183102/…   13:33:21
  • RT @cinii_jp : CiNii廃止？なくなるの？といったコメントをいただき大変お騒がせしております。検索サービスは今後も継続します。論文PDF提供サービスの終了と他機関への移行作業のため、現在アクセスできないファイルが多数存在しています。この点については各機関と協力し情報発信を進めてまいります。   13:33:50
  • RT @ibaibabaibai : お医者さんは何か治療して症状が悪化したら，まずそれを中止して原状復帰を確認してから次の治療を考える．これに対して，政治家や官僚は改革自体が業績になるのでイケイケの考え方になりがち．「本気の改革」も個々の点では良いことを指摘されているのだと思うが，大枠で官僚の論理に乗る点が気になる   14:55:30
  • 北大生協食堂、なぜかしら豚肉を使った丼だけが他のメニューより塩分すくなく（これは1.3g）、ついつい選んでしまう。測り売り海藻・野菜をたくさんとったので合計額は533円。 pic.twitter.com/V6dOntsOYm   15:04:01
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  • RT @GSI_chiriin : 国土地理院ホームページの人気サイト「古地図コレクション」がリニューアル！国土地理院が所蔵する古地図等を公開しております。 地図で歴史を知る。タイムトラベルの入口はこちら→ kochizu.gsi.go.jp pic.twitter.com/3NQnPeyFWe   17:22:22
• 2130 とら寝かしつけ …… また，いっしょに「ねおち」 ……

2017 年 04 月 06 日 (木)

• 0500 起床． ぐだぐだ作業． 朝飯の準備その他ばたばた． 0835 保育園着 …… ちかごろ， とらの出動がおくれぎみなんだけど …… うーむ， 私のせいかしらん? 0910 研究室着．
  • RT @datasci_blogs : 【JAGS News】 JAGS tutorial at useR! 2017 ift.tt/2oIXAYk I am giving a pre-conference tutorial on JAGS at useR! 2017 in Brussels o…   04:34:41
  • RT @datasci_blogs : 【StatModeling Memorandum】 『Pythonで体験するベイズ推論 ―PyMCによるMCMC入門―』の書評 ift.tt/2oIvxIm 特長 Pythonユーザが待ちに待ったPythonによるMCMC本ではないでしょうか。原著タイト…   04:37:46
  • We sleep less as we age because… pops.ci/h3ZUT8 ネズミでの実験．なぜ老齢個体は睡眠時間が短いか？脳内の「寝ろ」シグナル生成は年齢と関係ないが，そのレセプタが少なくなるので寝るべきなのに寝なくなる…とのこと．つらい…   04:49:47
  • JAGS tutorial at useR! 2017 martynplummer.wordpress.com/2017/04/05/jag… 今年の useR! （R の国際会議）はブリュッセル，JAGS 作者の Martyn Plummer さんは 3 時間の JAGS チュートリアルを担当するとのこと．   04:56:21
  • さよなら，探査機カッシーニ…土星系はタイタンなど巨大衛星の影響で軌道が乱れやすく，軌道修正用の燃料がなくなれば土星周回軌道は維持できない…今月23日ごろに20年間の任務を終え，土星大気圏で蒸発するでしょう…とのこと Science pops.ci/DXuT9Z   05:12:38
  • 「もっと好きなこと」をするために、今日を生きる（寄稿・ぱれあな） www.e-aidem.com/ch/listen/entr… ぱれあなさんの，仕事・子育て・自分を縛る鎖…   05:49:01
  • RT @koro485 : 統計による因果推論って、①サンプリングが適切であるという前提②データの測定が正しいという前提③モデリングが正しいという前提に加えて、「全ての交絡因子を観察済」の条件、各手法の使用に必要な前提などが揃ってると想定したうえでの結果の解釈よねん。   09:04:48
  • RT @koro485 : やはりMediationは因果推論のフロンティアだな。今日のセミナー、RobinsがPearlの批判バチバチで天才同士の戦いを垣間見た。   10:25:10
  • RT @iwaokimura : MathJaxが4月末日を持って自前のCDNを停止するので，適切に移行措置をとるべしということです： www.mathjax.org/cdn-shutting-d…   10:28:11
  • 「本をつくる」という仕事 honz.jp/articles/-/43925 "校正・校閲者は作家と編集者との間に入り、第三の目として誤字脱字、事実関係の正確さや文脈の間違いなどを冷静、かつ的確に指摘しなくてはならない。たったひとつの見落としがその書物の存在を否定する場合さえある…"   10:37:59
  • RT @joshigeyuki : 労働市場流動化の重要性がよくわかる「P医大のQ先生」の話が面白すぎる。 → 書評「医者の稼ぎ方」 jyoshige.com/archives/87933…   11:02:09
  • 最後の最後まで働きつづけるカッシーニ sorae.jp/030201/2017_04…   15:54:26
  • (引用) "Ubuntu 18.04ではデフォルトのデスクトップをGnomeにする。Unity8の開発は中止する。スマフォ対応は中止する" "これはなかなか衝撃的だ。たしかに、Unity8とMirはこの長年開発しているが、さっぱり日の目を見ないソフトウェアだった" twitter.com/EzoeRyou/statu…   15:58:17
  • Cassini gears up for its grand finale newatlas.com/cassini-grand-… あらら…土星探査機カッシーニの「グランドフィナーレ」という最後の軌道変更は今月 26 日に実施され，通信途絶するのは 9 月 15 日ごろ…なのか…   16:06:33
  • すごーく複雑な作図の「さるべいじ」…海溝の底にもぐりこむよーな下うけぎょーむやってたら…また生態学会さーばー上の大会 WordPress 復旧案件が…今回は Theme 再インストールでなんとかなりましたよ…いやはや…教訓（再掲）：風邪ひき高熱のときに WP をさわってはいかん！ pic.twitter.com/EyEDFlRVLO   16:46:45
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  • 疫学の SIR 動態モデルへのいろいろなあてはめ…MCMCとか粒子フィルターとか Approximate Bayesian Computation (ABC) とか教えてくれるコース www.lshtm.ac.uk/study/cpd/infe… があるそうで…昔は最小二乗法でも使ってたのかな？ twitter.com/arboviral/stat…   16:57:08
  • 生態学会さーば不調（←一部，自己責任あるいは自爆）…これは，だいぶかたづいてきたが…このレンタルさーばのハードウェア・ソフトウェアの今後はどうしたものか問題が「でん」と鎮座している．そして，別件の下うけ複雑作図作業ぎょーむはまだまだ進捗してないのに，すでに17時すぎ…   17:06:59
• 1750 保育園着． 2140 とら寝かしつけ …… 苦闘してます ……

2017 年 04 月 07 日 (金)

• 0550 起床． 朝飯の準備その他ばたばた． 0830 保育園着． 0900 研究室着．
  • RT @hiro32_n : 科研費挑戦的研究（開拓・萌芽）の採否の発表は7月中旬でした． pic.twitter.com/iE8kck0vjy   08:07:38
  • @windowmoon そうですね…今も一台占有なのですが，けっこう古くなっています．いろいろと検討してるのですが，とりあえず現在のレンタルサーバ会社と相談してみます．私のつまらない質問・要望にもわりと丁寧に対処してくれるので．   11:24:26
  • 生態学会さーばの未来，現時点の技術だと…DockerとかでOS環境を移行しやすくバックアップしやすく…という方向にできればラクかも．はてさて，CentOS な現環境，誰がこういう仮想化作業をするのか？…やっぱりプロの人におまかせするのがいいんだろうな．自分でやったら激バテしそう…   11:50:01
  • 今さら気づいたのだが…生態学会さーば CentOS 上の GUI である Plesk を作ってる Parallels en.wikipedia.org/wiki/Parallels… じつは仮想化をうりにしたシステム会社だったのか…えーい，何を選択すれば「めんどくささ」が最小化されるのだろーか？   12:00:38
  • @pjxiao はい．WordPress だけなら，それでも良いかもしれません…といいますか，学会の予算はあるので，いろいろな手はうてるはずなのですが，全体の移行作業がなかなかたいへんそうだな…という状況なんです（説明不足ですみません）   12:19:24
  • Twitter、軽量版の「Twitter Lite」リリース japan.cnet.com/article/350994… "端末上での使用メモリも1Mバイト未満となる" "Twitterによると、通常のモバイルサイトよりも読み込みが最大30％高速で、データ使用量は最大70％抑えられるという"   12:45:26
  • @pjxiao はい，そうです．移行しないのが一番ラクなのですが，占有している機器のハードウェアも次第に古くなり，OS のアップデートも基本的にダメとのこと（という契約）なので…いろいろと検討しております…   13:04:08
  • @pjxiao はい，それなりの規模の学会なので，たぶん予算面は問題なさそうですし，当方でスケジュールを決められるので，まあ，なんとかそういう方向で………   13:30:20
  • RT @watahoo_h : 円城塔さんの「ポスドクからポストポスドクへ」 大学院生の時にショックを受けて以来、「将来研究者になりたい！」という人には一読をお勧めしています。CiNii廃止の影響でもう読めないのかと心配しましたが、検索したら見つかったのでシェア。 goo.gl/zTpho1   13:50:30
  • うーむ，どこかで「パラメーター数がデータより多いのは NP 困難」とゆー「どこのファンタジー世界？」な記述をみたような気がするが…どこかで蒸発したようだ…あとは図版作成担当のかたの高度技術に期待…   14:53:43
  • 誰もが知る重厚長大マニュファクチャーから，「みどりぼん」著者あてに連絡が来てひっくりかえった…町医者あいてに iPS 細胞で網膜再生しろ…みたいなハナシなので，あわてて統数研の共同研究スタートアップ www.ism.ac.jp/shikoin/startup/ に誘導した…あー，びっくり…   14:59:06
  • RT @ibaibabaibai : なんかヘトヘト感半端ないけどds6のコメント書かなきゃなんないし 自分の原稿の専門家レビュー頼まなきゃなんないし 図版の許諾頼まなきゃなんない   16:40:17
  • @shima__shima ご教示ありがとうございます！…「新しい np 問題」知りませんでした…自分の不勉強に「ぞっ」としましたが…推定うんぬんについては「NP困難である」と書かれていました．もしかしたら「新しい np 問題」と（有名な）NP困難は同一と解釈されたのかもしれません…   20:40:33
  • 「新しい np 問題」（小文字で書く…「NP 困難」は大文字）を教えていただきました．ありがとうございます．樋口さんの2008年の講演ファイル www.ai-gakkai.or.jp/sigdmsm/007/DM… などに登場します．その p.4 の引用… pic.twitter.com/8nwEeFqdXH   20:56:06
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• 1750 保育園着． 2140 とら寝かしつけ …… 苦闘してます ……

2017 年 04 月 08 日 (土)

• 「きょうはきかんしゃトーマスの映画の日だよね！」 ととらに起こされて， 0630 起床 …… 小樽の映画館で「機関車トーマス the great race」 をみて， 二人で小樽ぷらぷら散歩しました．

2017 年 04 月 09 日 (日)

• 0600 起床．
  • ぼーい先生と早春のうろうろ自転車旅…北大・恵迪寮の壁画 pic.twitter.com/JGShcNweVb   10:52:20
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  • 昨日もぼーい先生とうろうろ旅。小樽で機関車トーマス映画 wikiwiki.jp/kei0420yuu/?%A… を鑑賞。小樽まで行った理由は、このシリーズは AEON CINEMA でしか上映されず（少なくとも北海道では）札幌市内では見れないので小樽往還となりました…   14:54:55
  • 昨日のぼーい先生のおたる旅、映画のあとは小樽築港駅から小樽まで坂道のぼったりおりたりの徒歩旅。「観光地ではない」小樽市内をふらふらしました。画像は途中通過点の南小樽駅駅、エゾヤマザクラがたくさん植えられていましたが…開花まであとひと月ぐらい？ pic.twitter.com/LxdSdUjg4x   15:01:36
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  • RT @koito_syashinn : 「人間の弱さ」を熟知したアサド政権 agora-web.jp/archives/20254… 米国が容認姿勢に傾いたから化学兵器を使い、米国が黙認することを反体制派に見せつけることで、どれだけ残虐な行為をアサド政権が行っても、どこからも助けが来ないと思い知らせ、戦意を挫けさせる。   15:57:49
  • RT @Anthunter1212 : アリ記載論文．従来の形態とマイクロCTスキャン情報も使っているのが斬新．ホロタイプ標本3D画像PDFも添付．画像を自由に動かして観察可能．タイプの3Dプリントも作成している．タイプ標本をダウンロードするサイバータイプ標本化も間近かと journals.plos.org/plosone/articl…   17:19:12
• 2120 とら寝かしつけ …… やや早めかな ……

2017 年 04 月 10 日 (月)

• 0600 起床． 朝飯の準備その他ばたばた． 0840 保育園着． 0910 研究室着．
  • 毎週月曜日朝にやってくる "Please inspect this machine, because it may be infected" 警告をどうにかしたい（例によって生態学会さーば！）…いやはや rkhunterことはじめ qiita.com/Peranikov/item…   05:40:09
  • RT @takehikohayashi : 大学の現状に関して『文科省が悪い』に終始してるアカデミシャンはまずこれ読んでほしい。まずはちゃんと先行研究を参照しようぜ／ なぜ日本の公教育費は少ないのか: 教育の公的役割を問いなおす 中澤 渉 www.amazon.co.jp/dp/4326653884/…   06:35:22
  • 今朝は……生態学会さーばーぎょーむではなく，大会一覧 www.esj.ne.jp/meeting/index.… の更新に意外とてまどってしまった…今ままで長いあいだ，このあたりは竹中さんにぜんぶやっていただいていたので．おっと，その竹中さんに連絡しなくては．   06:38:48
  • [R]Rの良いところと悪いところうんぬんのメモ d.hatena.ne.jp/dichika/201704… #stat "たまに見かける「Rの良いところは統計家によって開発されたことだ。そしてRの悪いところは統計家によって開発されたことだ」という言葉"…その出典は…？   10:02:55
  • 依存症は厳罰主義では解決しない natgeo.nikkeibp.co.jp/atcl/web/17/04… "今、立ち直ろうとしている他の人たちが報道に接して再使用してしまいかねない…みじめさや情けなさ、恥ずかしさや自己嫌悪を自覚した瞬間に、『シラフではいられない』渇望のスイッチが入ってしまいます"   10:56:11
  • 新年度めんどくさい雑用がイヤになっのでひとまず投げだし…VAR 時系列データ解析の解説文を読んでみたのだが…「お，やはりここはそうするのか」と整理できる一方…平滑化値で欠測値代入とかあれこれ検定とか…時間変化データのモデリングの定石って…「ここまでしなくても何とかなるかも」感が…   14:54:16
  • RT @f_nisihara : 日本政府の白書はほとんど学術論文を引用していないと。 - 「エビデンスに基づく政策形成」に関するエビデンス www.rieti.go.jp/jp/publication…   19:31:43
  • 今日は朝から晩までいろいろと失敗ばかり…だったなぁ…なにもかも新年度めんどくさい雑用がわるい…とゆーことにしておきましょう…   20:28:21
• 1750 保育園着． …… 苦闘 ……