ぎょーむ日誌 2016-11-(21-30)

2016 年 11 月 21 日 (月)

• 0620 起床． 朝飯の準備その他ばたばた． 0820 保育所着 …… 今日はけっこう早くついた! 0850 研究室着．
  • RT @KevinReuning : I support we immediately stop using * and use this instead.
    ¯\(ツ)/¯ < 0.01
    ¯\(ツ)/¯ < 0.01
    ¯\_(ツ)_/¯ < 0.05
    ¯\__(ツ)__/¯ < 0.10
    twitter.com/matt_blackwell…   08:56:57
  • コマンドラインで PDFファイルを操作できる pdftk en.wikipedia.org/wiki/PDFtk ふつーは pdftk file1.pdf cat … などとすればよいが，「回転」させるには pdftk A=file1.pdf cat Asouce…などと書かないとダメ？   10:32:52
  • "Bayesian Applied Regression Modeling via Stan" RStanARM なるpackage tjmahr.github.io/visualizing-un… CRAN cran.rstudio.com/web/packages/r… 「回帰」に特化した Stan ラッパー？   11:20:35
  • たとえば stan_glm() で (formula = switch ~ dist100 + …, family = binomial, …prior = student_t, …prior_intercept = normal(0, 10)) と指定するとこういう出力が… pic.twitter.com/Zg7loRkYD1   11:24:29
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  • rstanarm の関数には stan_glmer() というのもあり，library(lme4) ふうのモデル式指定が可能．.Rprofile で options(mc.cores = parallel::detectCores()) と設定しておくと自動的に並列計算を実施． pic.twitter.com/AaTat0qYpk   11:33:39
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  • RT @dosei_sanga : 科学と機械学習のあいだ：変量の設計・変換・選択・交互作用・線形性 www.slideshare.net/itakigawa/ss-6… @SlideShare さんから 高次元の偽相関は注意したい。ニューラルネットでは超高次元だとそもそも埋め尽くすほどデータがないので起こりにくいみたいな話も聞く。   13:01:31
  • RT @mattn_jp : 「Windows から bash on Windows のファイルは触るな、再インストールするハメになるぞ」 / “Do not change Linux files using Windows apps and tools –…” htn.to/4eEYYu4YKsj   13:24:56
  • アリに学べ！ロボットの集団行動最適化プロジェクト - Togetterまとめ togetter.com/li/1051033 @togetter_jp さんから "そもそもは，人が操縦するロボを作っても面白くないのでアリが操縦するロボットを作ってみようというのがはじまりでした"   13:44:07
  • 半年以上前にリリースされてるけれど library(loo) Efficient Leave-One-Out Cross-Validation and WAIC for Bayesian Models cran.rstudio.com/web/packages/l… 蛇足ながら loo はトイレ? pic.twitter.com/7NZbioTSpN   16:15:48
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• 1750 保育園着． 2140 とら寝かしつけ …… 苦闘してます ……

2016 年 11 月 22 日 (火)

• 0600 起床． 朝飯の準備その他ばたばた． 0830 保育所着． 0900 研究室着．
  • RT @thoughtalice : Trying anything on a Monday morning pic.twitter.com/oBUDotnlTo #planetearth2   06:00:03
  • (国はたぶん USA) 1880 年から現代までの「よくある名前」（男女それぞれ）の変遷グラフ michaeltoth.me/popularity-of-… pic.twitter.com/kqAcnzvfEV   11:00:28
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  • RT @_lionelhenry : ggstance now available on CRAN! Horizontal components for #ggplot2 ( github.com/lionel-/ggstance ) #rstats pic.twitter.com/xOrfL0BfCW   11:01:20
  • RT @math_gif : 正七角形の内部を正方形が転がるときの頂点の軌跡です。 正三角形と違い、どの頂点を中心に転がるかによって軌跡の弧の半径が変わります。 #数学GIF pic.twitter.com/YGziXdo0Fy   11:05:50
  • 粕谷さんブログ qdai.way-nifty.com/qjes/2016/11/p… 偶然ながら私も同時期に新潟大に行ったわけだが…バス亭「新大中門」バス亭に気づかなかったし（そのへんうろうろ歩いていたはずなのだが）…もしそのバス停をみたとしても「しんだ・いなかもん」読みには気づかなかっただろう… pic.twitter.com/45xGWxOqrc   11:19:34
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  • 北大正門前のカレー屋さんに三日間かよって「あてた」 www.ichibanya.co.jp/cp/thunderbirds/ ４号（水流ジェットノズルのパーツはまだ装着してない）．なんだか…「どこかのサンダーバード好きな４歳時」に遠隔操作されているよーな気がしてきました… pic.twitter.com/tXINj1BOp0   12:35:07
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  • RT @ysk24ok : みどりぼん3章について自分の理解をまとめた。 ysk24ok.github.io/2016/11/22/mid…   12:51:24
  • RT @shigepong : IBIS2016チュートリアルに「自分このあたりホントに全然分かってないんで勉強させてもらいに来ました」って言って２万円の自腹切って参加してた周辺分野の重鎮な先生方を横から見てる時の戦慄っていうヤツをぜひ伝えたい。   13:00:31
  • 「民営化３０年　瀬戸際のＪＲ北海道」（時論公論） #nhk_kaisetu www.nhk.or.jp/kaisetsu-blog/… "多くの赤字路線を抱え事業の抜本的な見直しを検討していたJR北海道が、「単独では維持できない」とする区間を発表…路線全体のおよそ半分にのぼり、地元に衝撃" pic.twitter.com/kWv9zCxpEb   13:05:25
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  • 「日本期待の原発輸出　白紙に」 #nhk_kaisetu www.nhk.or.jp/kaisetsu-blog/… "多額の債務…建設コストの高さなどをベトナム政府は理由に" "日本は…ベトナムでは官民あげてオールジャパン体制で臨んで受注に成功し、今後の原発輸出に弾みをつけたいところでした"   13:17:00
  • RT @Shimazono : 【ベトナム・原発からの「勇気ある撤退」の理由とは】 foejapan.wordpress.com/2016/11/19/vie… 　なぜ、ベトナムは原発からの撤退を決断したのか？国会議員で科学技術環境委員会副委員長のレ・ホン・ティン氏がVNEXPRESSのインタビューに答える（11/10）。   14:08:11
  • RT @naka8952 : ベトナムが日本の原発輸入を断った理由は資金不足と報道されているが、実際は違うはずだ。ベトナムは経済成長が著しく一旦見通しの立った資金計画が狂う状況にはない。ベトナムはフランスの事情に精通している。フランスでは今日本の原発部品が原因で多くの原発が停止に追い込まれている。それを危惧か   14:08:52
  • RT @PFU_HHKB : 2016年12月、HHKBシリーズは発売20周年を迎えます。これもひとえに皆さまのご支援の賜物です。 HHKBの歴史を俯瞰していただけるよう、20周年特別サイトをご用意いたしましたので、ぜひご覧ください。 www.pfu.fujitsu.com/hhkeyboard/20th/ #HHKB pic.twitter.com/XvepnmefPl   14:18:24
  • ひさしぶりに北大院生のデータ解析こんさる…個体ごとの「花数」は過剰分散 (overdispersion) ではなく過小分散 (underdispersion) になってる…平均よりも分散が小さい．けっこうめんどう．R package では，ちょっと無理そう．なにか工夫が必要かも…   16:52:03
  • RT @berobero11 : 殿！こんなこともあろうかと靴を暖めておきました。役に立たないかもですが。 statmodeling.hatenablog.com/entry/underdis… twitter.com/kubobook/statu…   20:25:00
  • RT @doctorsnowman05 : 最高気温とは思えぬ数字並ぶ明日の北海道。 真冬かよっ😖 www.hbc.co.jp/weather/h_tm_k… pic.twitter.com/yVsnD0STgW   22:02:35
  • RT @ibaibabaibai : メカニズム的には反発力とか規則配置なんだよね 鴨川のカップルも過小分散 過大分散は引力でも起きるけど不均一性で代用可能 一種の平均場近似みたいなもので内部場を不均一な外部場と思う twitter.com/berobero11/sta…   22:07:59

2016 年 11 月 23 日 (水)

• 0600 起床． 朝飯の準備その他ばたばた． 0930 研究室着．
  • RT @ANTAM_Mk4 : 集団を絶滅させる”裏切りアリ”の謎に挑む – 京大・土畑重人博士 academist-cf.com/journal/?p=2425 ANTAMチームの土畑先生のインタビュー記事です。生物学者としてのANTAMの活用について触れて頂いています！ #ANTAMproject   06:04:40
  • RT @annbot : Earlier Functional significance of crown shape diversity&plasticity in tropical trees j.mp/2fjmYOk Paper j.mp/2fjn0Wh pic.twitter.com/mnkMXXyyKG   06:07:10
  • RT @Anthunter1212 : 世界を侵略しそうなアリをエチオピアで発見という論文．このアリは固有種で遺伝的多様性も高いが，38kmに渡るスーパーコロニーで営巣とか．アリの場合ボトルネックによる多様性低下が侵略種形成の仕組みとされてきたので，その考察に一石らしい． link.springer.com/article/10.100…   06:07:29
  • RT @hoxo_m : “高次元データの次元削減および2次元プロット手法 - Qiita” htn.to/cSb231   06:07:48
  • RT @berobero11 : I庭先生「本はよく書けてますよー。あれは売れますよ。ただ、勉強が足りん、勉強が。」I波編集「いいと思います。ただ、さっき話してくれたような例示などの遊び心がもっとあってもよかったかな。あれだけで読者は安心して入り込めます。」ありがとうございます。天牌の黒沢さんの帽子や。   06:10:45
  • 札幌の気温、どんどん低下中。昨晩は零度ぐらいだったけど、今はマイナス4℃ぐらい、このあとマイナス6℃ぐらいまで低下するとか。北大構内ながれるサクシュコトニ川、氷結。 pic.twitter.com/sqvS20Z5MI   09:14:25
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  • RT @Kyukimasa : カッシーニが最期のミッションに向けた軌道変更の準備 www.nasa.gov/feature/jpl/na… 輪すれすれに飛んで羊飼い衛星などの近接観測。輪と20回ほど交差したら「グランド・フィナーレ・フェイズ」なんだな pic.twitter.com/g7zf6HN8hp   09:49:01
  • RT @annbot : Rice farming in India much older than thought, used as 'summer crop' by Indus civilisation j.mp/2fAUFMf (hat tip to @vpsahi ) pic.twitter.com/vAkNfjxEcj   09:49:54
  • RT @cloudnewsj : Ubuntu 16.10–クラウドとコンテナのためのLinux [ #cloud ] cloudnewsj.com/2016/10/21/ubu…   10:39:43
  • 札幌市の気温低下，進行中．マイナス５℃ぐらい．建物の外にでると「これなに？」と混乱する寒さ．とにかく，いきなりの気温低下で，まだカラダが寒さに慣れてないなくて…… pic.twitter.com/UWluVGSXni   13:33:15
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  • RT @willyoes : 過労ってこういう状態なんだな。参考になった。いや参考にしてはいけない。 note.mu/hellomisaki201…   13:38:48
  • RT @datasci_blogs : 【Technically, technophobic.】 ifelse()は危険なのでやめてdplyr::if_else()を使いましょう ift.tt/2fDHWIt dplyrパッケージのif_else()、case_when()、recode()の紹…   13:39:10
  • RT @asahi_igo : 村）囲碁AIはまだまだ進化しそうです。次の対決はいつでしょうか。　趙治勲名誉名人、囲碁ＡＩ破りシリーズ制す　囲碁電王戦：朝日新聞デジタル www.asahi.com/articles/ASJCR…   22:21:38
• 2130 とら寝かしつけ …… 苦闘 ……

2016 年 11 月 24 日 (木)

• 0600 起床． 朝飯の準備その他ばたばた． 0810 保育園着 …… 今日はちょっと早く保育園についた!! 0840 研究室着． だんだんカラダが寒さになれてきた．
  • 北大に“大本営”があった？農学部前「聖蹟碑（せいせきひ）」とは @retrip_news retrip.jp/articles/67911/ "昭和11年（1936）に開催された北海道陸軍特別大演習でこの地に大本営が…" "弘前の第八師団が南軍として、旭川の第七師団が北軍として…"   08:53:20
  • RT @h3iwamot : この時に農学部3階の農経会議室が陛下の御座所となり、僕が学んだ院生室は陛下のトイレだったと聞いている。 twitter.com/kubobook/statu…   09:04:57
  • 『落葉樹林の進化史』 honz.jp/articles/-/43551 "落葉樹林を切り口にして、中生代からの森林生態系の進化史を論じるという時間的広がりもさることながら、人間社会からの影響などを、3つの大陸にあてはめて論じるという空間的広がりも実に壮大である"   09:43:08
  • 一昨日，オバマ大統領が #MargaretHamilton さん (有人月往還アポロ計画のソフトウェア開発者の一人）を顕彰した…という良いニュースなのだが，ESA（アメリカ生態学会）がこれを RT する理由がよくわからない…ESA twitter 担当者のシュミ？ twitter.com/MIT/status/801…   11:07:52
  • 牧野さん・大橋さんの訪花昆虫論文（ #FunctionalEcology ）の要旨が４コマまんがに！花序はどうすれば「目立つ上に嫌われない」のか？英語版もあり twitter.com/MakinoTT/statu… twitter.com/MakinoTT/statu…   11:16:53
  • RT @T__J : これ 弾がゼラチンを貫通する衝撃よりも ゼラチンが膨張した姿から元に戻ろうとするときに 中にあった空気が圧縮されて内部爆発起こしてる衝撃のほうが大きいのすごい pic.twitter.com/QwfStBvN3H   14:11:50
  • Nature Communicationsでは、透明性の高いピアレビューを本格導入 www.natureasia.com/ja-jp/info/pre… "著者には、この制度を利用しないという選択肢が認められていますが、査読者は全て、匿名の査読者レポートが公開される可能性があることに同意しなければ…"   16:42:36
  • RT @bluebacks_pub : 【『種の起源』出版日を祝して】１８５９年の今日誕生した名著に敬意を表して、ブルーバックスから新たな進化の定番本が登場！ 古生物・化石ファン必携──全米200大学採用「進化の教科書」ついに翻訳！ news.kodansha.co.jp/20161123_b03   16:44:10
  • RT @simizu706 : 11月23日に行われた「StanとRでベイズ統計モデリング」読書会の発表資料をスライドシェアにアップしました。初回ということもあって，本の内容と清水の解説も加えてあります。今回参加できなかった人は見てもらえるといいかと思います。 www.slideshare.net/simizu706/stan…   18:16:05
  • RT @skmt_kun : 中学生のころだったか、赴任してきた（若めの？）先生のプロフィールに「歯舞中学校 出身」とかいてあって、北方領土から来たのか！！とけっこう本気で思ったことがあったけど、根室市には歯舞という地区があるのよね   21:32:16
  • RT @Trends_Ecol_Evo : Up next and new from @IsldJames and @TimBlackburn66 The Rise of Invasive Species Denialism bit.ly/2fIIgFS pic.twitter.com/g3ubUSz75E   21:32:51
  • RT @mehori : 気候的にみると、今回の寒波は北極が温暖化していて寒気を中緯度に押し出しているから起こっているという側面もあります。地球上の海氷の面積の今年のグラフをみると、明らかに今年（赤線）は異常でまるで北極が冬になるのを拒んでいるみたい。いま研究者はこれで大騒ぎ pic.twitter.com/XhyHMY2ExC   21:33:59
  • 恐竜ぼーい先生ねかしつけ…恐竜図鑑よんで「そろそろ消灯」とまっくらにして「6500万年前，直径 10km の小惑星が秒速 10km でメキシコ湾に落下しました…」とおきにいりのハナシでいつもより早めに寝た．この YouTube動画◯ www.youtube.com/watch?v=vuet3t…   21:45:20
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• 1750 保育園着．

2016 年 11 月 25 日 (金)

• 0600 起床． 朝飯の準備その他ばたばた． 0820 保育園着． 0850 研究室着．
  • RT @LukeHolman_Evo : My attempt at a gene co-expression network looks like the death star! @accidental__aRt pic.twitter.com/MRwuPaHTxc   06:01:33
  • RT @skmt_kun : 北12条の牛舎がなくなったともったっけ、隣の道銀もなくなってるや！なんてこと！   06:01:38
  • RT @FunEcology : ONLINE AS ACCEPTED: Honest floral colour change to maintain a long-lasting relationship with pollinators bit.ly/2gqevLh pic.twitter.com/j6IMJAjs5f   06:02:40
  • RT @hillbig : 粒子数やグリッド数に応じて計算量が爆発的に増加してしまう流体シミュレーションをCNNを使って近似することでリアルタイムでシミュレーション可能。CNNのおかげで計算量は一定 cims.nyu.edu/~schlacht/CNNF… www.youtube.com/watch?v=9pXubx…   10:48:31
  • 仕事からの現実とーひ Bash on Windows qiita.com/tags/BashOnUbu… と TightVNC qiita.com/nanasess/items… インストールしたんだが…なんか「これじゃない」感がぬぐいきれなくて…まあ GUIはともかく bash は便利 pic.twitter.com/YARsmrQpsQ   17:03:20
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  • さらに…さらに，どーでもよいことだが…Bash on Windows が動いてる状態において，Linux から ssh すると接続できた…しかし bash は使えない．何か方策があるんだろーけど…非生産的な現実とーひはやめて，さっさと仕事を完了させよう… pic.twitter.com/bKr8Jmr8mL   17:27:02
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  • @KentaroOgawa …なるほど…ありがとうございます．   17:43:35
  • bash on Windows のため開発者モードを選択すると sshd 起動するかも…との懸念から，止め方を調べてみた→fftest33.blog.fc2.com/blog-entry-121… コントロールパネル内の管理ツールを使って止めることができました． pic.twitter.com/goztI3sYJk   18:33:08
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  • あらら…とんでもないトラブルかも．集中講義のレポート提出用の CGI フォーム（自作）エラーを出して動いていない？   19:42:13
  • 集中講義のレポート提出用の CGI フォーム（自作）問題…原因は permission が 775 になっていたことだった…どうしてこんなことに？わけわからん．とりあえず chmod 755 で解決したが…また受講者のみなさんに連絡しなくては…いやはや．   19:56:02

2016 年 11 月 26 日 (土)

• 0600 起床． 朝飯の準備その他ばたばた．
  • 今年のカキは安くておいしい…よーな気がしたので、ついつい買いこんでしまう。ぼーい先生もぱくぱく食べるし。今朝はジャム作りにとりくんでみました。 pic.twitter.com/0eixfRHh88   06:24:26
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  • RT @jimanalyze : 独立心旺盛なベトナムがなぜフランスの支配を受けたかというと、ベトナム人とフランス人の気脈が通じたからだ、という説もある。礼儀を重んじること、プライドの高いこと、食に対するこだわり、子どもの教育に厳しいところ等々。   06:25:18
  • RT @jimanalyze : ベトナムの歴史の面白いところは、外敵に攻められまくり何度も滅亡寸前になりつつも都度不死鳥のように蘇るところと、そんなリスキーなこと毎度やってられんってんで、南のチャンパーを滅ぼしてしまうような血みどろの侵略戦争も並行してやってきてるところ。根っからの戦闘民族ですね。   06:25:47
  • 今朝の発見：柿はごく簡単に液状化する。 pic.twitter.com/oauUFqXWJ8   06:44:21
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  • リンゴパンケイキ。今朝は炊飯鍋ではなくフライパンで焼いてみました。こちらのほうが、ややドライ？ pic.twitter.com/mDIz5SVLBp   07:19:45
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  • RT @math_gif : 楕円の焦点から放たれた光線が楕円の内側の鏡面を反射する時、もう片方の焦点に向かいます。 また楕円上の点から２つの焦点への距離の和は一定なので、片方の焦点から同時に放たれた光線は、同時にもう片方の焦点にたどり着きます。 #数学GIF pic.twitter.com/0fhIFNsFSI   14:14:49
  • RT @datasci_blogs : 【廿TT】 状態空間非定常ポアソン（NHPP using Stan） ift.tt/2gpP6Ao ポアソン過程は再発事象のモデルとしてよく使われる。 ポアソン過程ではイベントが観測された時刻を () とすると、イベントの生起間隔 は独立にパラメータ…   14:18:40
  • 土曜日午前、ぼーい先生と自転車&路面電車で札幌市内うろうろ旅。帰宅・昼飯後「ひるねなんかしないもんね〜」宣言に対抗するべくオンラインリアルタイム「がうしあんおはなし生成モデル」と化して20分がんばって…敵一番艦沈黙…ぱぱぱわーも尽きたのてコーヒー休憩… pic.twitter.com/X2DrLeFnxu   14:35:40
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  • RT @daimuro : 『恐竜大紀行　第10話　英雄ドン』出しました。よろしくお願いします！ amzn.to/2fOMHPF 　英語版はもう少々お待ち下さい。   19:06:44
  • 午後は昼飯後にぼーい先生の昼ねかしつけ…午前あちこちに移動という伏線がきいて，あっさり寝た．夜ねかしつけを考慮して一時間ちょいでおきてもらう．その後は恐竜おはなし．晩飯…うーむCoCo壱サンダーバード景品がまた増えた．夜はサンダバードおはなし寝かしつけ…いやはやもう21:30か… pic.twitter.com/wL2Ahx7Xip   21:52:10
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  • くたびれ感がつのってきたので夜中にコーヒーのみつつ…明日一日のぼーい先生わんおぺ計画を検討…長時間おでかけは，ラクな側面もあるが…昼寝というオプションをどう使うかが難しい最適化問題…最適性など，どこにもないような気もしてきたけど．   21:56:34
  • Charles M. Stein [1920-2016] xianblog.wordpress.com/2016/11/26/cha… スタインの縮小（shrinkage）推定量 en.wikipedia.org/wiki/James%E2%… で有名…階層ベイズモデルの起源のひとつを提案した統計学者，と言えるのかも…   22:19:04
  • RT @POPOHEJUSEYO : 階層ベイズなんてものが浸透していないころろに、縮小推定量を見つけたスタインはすごい。階層ベイズ的に考えると多変量正規分布の平均の推定において、不偏推定量が許容性を持たないってことは尤もなんだよな。そして、タグチメソッドの田口玄一も独立でリッジ回帰や縮小推定に近いものに辿りついてる   22:42:29
• 2130 とら寝かしつけ …… 苦闘してます ……

2016 年 11 月 27 日 (日)

• 0620 起床． 朝飯の準備その他ばたばた．
  • @ibaibabaibai パイプ樹木とはすこし距離があるようなかんじですが…工学部の人たちの「最適」好き＆徹底追求には感心させられました．数理生態学の「最適」とやらはここまで根性がはいっていなかったです．   15:19:07
  • 昨日と同様、朝からぼーい先生と札幌市内うろうろ自転車旅。最高気温5.5℃なので「暖かい」感。北大博物館でパラサウロロフスながめたり。14時ごろ帰宅。30分使って何とか昼寝かしつけ…このあとの展開は…日没前のおでかけイヴェント発生を予測。さてさて、どうしようかな… pic.twitter.com/csI6KXgNN7   15:26:35
  • 
  • use_testthat()でテスト用のディレクトリ・ファイルを一発で作る - My Life as a Mock Quant (id:teramonagi / @teramonagi ) d.hatena.ne.jp/teramonagi/201…   15:33:22
  • Instead of “confidence interval,” let’s say “uncertainty interval” andrewgelman.com/2010/12/21/let… 日本語でも「信頼区間」ヤメて「不確定区間」区間とかいったほうがすっきりするような…   15:46:39
  • 「95% 不確定区間」は「？」なかんじもするが…「95% 信頼区間」も「え？信頼？」といったとまどいが生じうるので，どっちもどっちで，許容される？ベイズだと「事後分布 95% 区間」とニュートラルっぽくあいまいさのない表現なので，より良い表記になっているではないでしょーか…   15:51:46
  • たんなる印象論ですが…頻度主義の区間推定の解釈パズルは難しすぎる．形式的にはこれで正しいんだから最後は読者が自己責任で正しく読解して結論しろ…みたいなある種の権威主義？…被害妄想がコンタミしてますが．みどり本＆その講義スライドのSEの説明もぐだぐだ．ベイズはホントにらくで楽しい．   16:08:07
  • おっと……ぐだぐだしてる場合ではない…ぼーい先生を昼寝の世界からつれもどさなくては…夜，なかなか寝てくれなくなるんで…   16:09:32
  • 「昼寝しすぎて夜に眠れなくなったら困る」…などという担当者の一方的なつごーで強制的に眠りの国から拉致されてきたぼーい先生…不機嫌のきわみをやり過ごしてから、かねて用意のミカンを手渡すと冷温停止してくれました… pic.twitter.com/OiUvdCBanw   16:37:30
  • 
  • RT @tetsuroito : 先程の資料です/20161127_Japan.R Rでカルマンフィルタ speakerdeck.com/tetsuroito/201… #japanr   16:49:42
  • RT @kazutan : 今日私が発表したスライド「Rで本を作りたい」を公開しました→ kazutan.github.io/JapanR2016/Jap… リポジトリはこちらです→ github.com/kazutan/JapanR… 不明な点がありましたらご連絡ください #japanr   16:57:16
  • RT @yutannihilation : Tidyverseとは www.slideshare.net/yutannihilatio… 先ほどの発表資料です！ #JapanR   17:04:55
  • 土日単独キャンペインの掉尾をかざる「夕食→寝かしつけ」フェイズ…好物メニュー厳選し，「恐竜セミナー」拝聴し，入浴してもいいか気分を喚起し，とんとん＆おはなし…珍しく20時台に就寝．こんなオプティマイズは何だかヘンだが，育児下手なヒトほど柔軟性のある作戦計画が必要ではないかな，と…   21:45:19
  • 育児下手が時間軸にそった最適化をして，寝かしつけ後の自由時間をかせいだわけだが…ぐったり駄文を打鍵するばかりで本末転倒感なきにしもあらず…まあ当事者のだれも不幸になってないので，よしとしましょう…「おはなし」時間最大化ねらったぼーい先生，昼間の体力消耗という伏線が回収されてぱた寝   21:54:53
• 2040 とら寝かしつけ …… さくせん勝ち? ……

2016 年 11 月 28 日 (月)

• 0620 起床． 朝飯の準備その他ばたばた． 0820 保育園着． 0850 研究室着．
  • きっと宇宙にまで連れて行く──『ニワトリ 人類を変えた大いなる鳥』 - 基本読書 huyukiitoichi.hatenadiary.jp/entry/2016/11/… "あまりに速く肉をつけるようになったので、骨格の成長がおいつかず脚や腰の病気が引き起こされ、大勢の鳥が慢性的な痛みを抱え満足に歩けもしない"   11:25:21
  • RT @tomomoto_LV3 : 発表資料あげました（スライド上げるの初めて） #japanr speakerdeck.com/tomomoto_lv3/d…   13:09:18
  • 院生データ解析こんさる，前回は「過小分散」にひるんで…今回は「ゼロ過剰カウントデータ」．CRAN に zero-inflated GLMM推定関数あれこれあるが，いまいち．JAGSだと混合分布モデル化?…あ，親切な人たちが例示を… stats.stackexchange.com/questions/1596…   15:13:49
  • RT @BES_QE_SIG : Meeting report: Point Processes for Ecology June 2016 besquantitativeecology.wordpress.com/2016/11/28/mee… pic.twitter.com/lNF3qDrIoR   22:53:51
  • RT @ibaibabaibai : ５巻の特集原稿が大部分集まってきましたが，池田さんの総論も井手さんのglassoもほかの人のもすばらしい出来です．学会誌の特集とか技術ブログの記事とか結構あるので錯覚していたけど，日本語のテキストって数理的に難し目の青本くらいしかないんですね．５巻お買い得だと改めて思った．   22:54:40
  • 眠いけど寝たくないぼーい vs 体力消耗したくない寝かしつけ担当の膠着戦線…今晩は「自分が完全に寝るまでそこに留まれ」ドクトリン発動…真っ暗な部屋の中で「もう寝てるはず」とベイスを離れリードを取ろうとしたのだが…眠りの深淵にずり落ちつつ執拗に牽制球なげてくるので脱出できなかった…   23:20:56
• 1750 保育園着． 2210 とら寝かしつけ …… 苦闘してます ……

2016 年 11 月 29 日 (火)

• 0600 起床． 朝飯の準備その他ばたばた． 0820 保育園着． 0850 研究室着．
  • 保育園までの道のりは「吹雪」…でした。がんばれ道産子。 pic.twitter.com/WH4fjM3jQW   09:03:53
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  • 人口が半分になるように都道府県を二分割してみたまとめ - Togetterまとめ togetter.com/li/1053132 人口が集中分布しているとゆーか…平野部が集中分布してるというか…ただし北海道には無人の広野がひろがっておりますが．   09:07:13
  • en.wikipedia.org/wiki/National_… によると世界のいろいろな国で「樹木の週」とのことで MEE の森林データ解析の仮想特集号．パッチ動態・二酸化炭素同化・動物の生息域アセスメント・レーザレーダによる林冠構造の解明などなど… twitter.com/MethodsEcolEvo…   09:26:06
  • あ，Functional Ecology でも Virtual Issue: National Tree Week 2016 …こっちにもレーザーレーダ論文あるぞ…とクリックしてみたら MEE のサイトに飛んでいった．ふりーだむすぎる… twitter.com/FunEcology/sta…   09:32:07
  • RT @ogugeo : ロンドンで朝を迎えました。昨晩はヒースロー空港に深夜に着いたため、空港の中にあるYOTELというホテルに宿泊。英国で回転寿司を運営するなど日本的なYO!社が作ったカプセルホテルの変形版。ベッドはカプセル風だがシャワーやトイレを含む個室。カプセルホテルの約3倍の料金だが立地は最高。 pic.twitter.com/EU2uKwUdLC   09:43:10
  • 岩波文庫がISBNコードを上書き使用している件について - Togetterまとめ togetter.com/li/1053696 @togetter_jp さんから   09:44:38
  • Phenomenological vs. biophysical models of thermal stress … onlinelibrary.wiley.com/resolve/doi?DO… Ecology Letters．ここでいう水温と生存率の現象論的モデルってのはこんなの．生物物理モデルに敗北 pic.twitter.com/kTKbGcLAar   09:57:25
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  • The…logistic equation: Verhulst vs. Lotka onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/ec… 人口増加のロジスティック方程式モデル，Lotka版 r-Kモデルと19世紀の Verhulst 版ではいろいろ違いがありますよ…というだけの内容？   10:23:45
  • 生物群集データ解析のハナシの中でディリクレ多項分布の最尤推定する関数 dirmult cran.r-project.org/web/packages/d… が使われてた．プロファイル尤度（ランダム効果の分散の最尤推定値を使うやつ）が評価される．glm()っぽく使える？「スパースなデータ」では難しい？   12:20:29
  • あ，発表者が使ってたディリクレ多項分布の glm()っぽいあてはめ関数は MGLM package cran.r-project.org/web/packages/M… の MGLMreg 関数でした．すみません．最尤推定しているのでこれもプロファイル尤度？ドキュメントにはそう書いてないけど．   12:40:58
  • ぼーい先生に「情」と「恐怖」だけで自由自在にあやつられているダメぱぱがここにいますよ…… twitter.com/stdaux/status/…   12:42:13
  • 北海道大学スラブ・ユーラシア研究センター公開講演会「クリミア・タタール人：その過去と現在」…この時間はぼーい先生と晩飯くってるので参加できませんが…スラブ研って印象としては「いちばん北大っぽい」＆なんかスゴいひとたちの集団のような．農学部とか低温研とかそういうかんじはあまりない… pic.twitter.com/3njUooz1pH   13:56:08
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  • あ，公開講演会「クリミア・タタール人：その過去と現在」のリンクはるの，忘れてました… src-h.slav.hokudai.ac.jp/jp/seminors/sr…   13:57:29
  • 質問→回答メモ：INLA (integrated nested Laplace approximation) www.r-inla.org そのRパッケージもあって，初出論文では www.math.ntnu.no/%7Ehrue/r-inla… 森林調査地データの解析をしている   14:43:08
  • まあ，自分ではつかうことなさそう…という予感   14:46:35
  • またまた質問メイルへの回答メモ：さきほどの INLABMA: Bayesian Model Averaging with INLA cran.r-project.org/web/packages/I… で森林を三角に切るのは？…有限要素法を使うからだろう…と検討をつけて本文よんだらそう書かれていた． pic.twitter.com/XOazYr2Xfa   16:43:03
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• 1750 保育園着． 2120 とら寝かしつけ …… いっしょにねおち ……

2016 年 11 月 30 日 (水)

• 0620 起床． 朝飯の準備その他ばたばた …… 今朝はちょっと手順を変えて， 時間短縮をねらったのだが …… けっきょく， いつもどーりの 0820 保育園着． 0900 研究室着．
  • 21時ごろ恐竜図鑑よみで恐竜ぼーい先生の寝かしつけ…しかし、自分もばたと寝落ち…午前2時前に目がさめて…なぜか洗濯ぎょーむにとりくんでおります… #ワンオペ pic.twitter.com/8qEuhWl4kW   02:12:27
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  • RT @k_naruse : 今日の豊ヶ岡駅 雪が多いので、除雪しました。 pic.twitter.com/GanfoObN6i   12:30:54
  • bash プロンプト上から R を起動しようとして…コマンド名 "rstudio" の脳内検索に15秒間を要して一時的ふりーづ…まだまだアタマ壊れてるな…しかし，そこで失笑してるあなた，GUI なデスクトップ上でアイコンちこちこしてソフトウェア起動してるんぢゃありませんか…？   15:51:54
  • 複数のhistogramを重ねて描きたい (Qiita) qiita.com/hoxo_b/items/2… geom_histogramのデフォルトのposition を stack ではなく identity と指定する…とのことのようで．   17:07:07
  • お，うまくできた！ pic.twitter.com/NFZ1HbSYlg   17:22:07
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  • RT @nekotausagi : 豆腐の「常温」販売を解禁へ　非常食での利用も可能に：朝日新聞デジタル www.asahi.com/articles/ASJCY… こんなん当たり前やねん。常温販売って言うても生の豆腐じゃなくてブリックパックに入った奴。海外だと棚の上に置いて売ってるのでも法律で冷蔵しろって売らせてたん。   18:27:10
  • 今晩も #わんおぺ …恐竜ぼーい先生の寝かしつけハナシはパキリノサウルス ja.wikipedia.org/wiki/%E3%83%91… 30 分ぐらいのおはなし＆10分間「とんとん」でなんとか寝てくれました． www.youtube.com/watch?v=jv7hRB…   21:49:57
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  • @berobero11 @kazutan Docker コンテナとか，そもそもハナシがぜんぜんわかっていませんが…MCMC 可視化系というと ggmcmc とか…でしょうか?   21:54:46
  • 油断してるとアウトプットの洪水にながされてしまう library(ggmcmc) twitter.com/KuboBook/statu…   22:00:08
  • RT @misterspotlight : CTスキャンにかけられたライオンの寝顔を正面から覗いたら完全に猫だった！ buff.ly/1ECaVXd pic.twitter.com/oii9sPFmRJ   22:07:47
  • RT @ibaibabaibai : うおー 魚 twitter.com/wired_jp/statu…   22:08:49