KuboLog 2014-01-16

苦情・お叱りは，たいへんお手数かけて恐縮ですが，久保 (kubo@ees.hokudai.ac.jp) までお知らせください．

2014 年 01 月 16 日 (木)

0555 起床．朝飯・弁当の準備．朝飯．とらめし．コーヒー． 0820 自宅発．晴．なぜか「運動のため部分徒歩通勤」の大原さんにばったりお会いしてしまった …… 0830 保育所着． 0910 研究室着．

データ解析こんさるにそなえて， R を使った空間統計解析のべんきょう ……

10 時から Jordan さんのデータ解析こんさる． library(spatstat) の nncorr() 関数を使うと，下の図のようなデータ (これは nncorr() の example で使われる finpines という樹木の直径・樹高データ) から「最近傍個体 (nearest neighbor) 間に直径 (あるいは樹高) の負の相関があるかどうか」といったことが調べられる．

ところが Jordan さんの質問は，個体の mark が factor であるような場合，たとえば「A という種類の個体の最近傍個体が A (あるいは B) である確率」などをみて「A どうしは同じ場所に集まっている性質がある」とか言いたい …… ということで．

これは library(ecespa) の dixon2002() 関数を使えばよい，ということを確認した．これは nearest neighbor cotingency table (最近傍個体分割表) を作り，期待値からのずれの大きさを調べようというもの．ずれの大きさはモンテカルロ法 (random labeling) で評価される．

昼飯．ちょっと電話雑用．札幌市中央区の保育所関係の問い合わせはココ，ということで ……

来週の月曜日・水曜日のじゅぎょー準備 ……

じゅぎょー準備に関連して， KuboWeb 内の CGI あれこれを動かさねばならないのだが …… 先日 Ubuntu 13.04 を 13.10 に変更した「余波」で， 403 Forbidden が出てしまった …… 毎度毎度のことながら．

こちらの forums とかも参考にしながら，現状ではとりあえず下記のごとき /etc/apache2/mods-available/userdir.conf で何とか動作しております ……

<IfModule mod_userdir.c>
	UserDir public_html
	UserDir disabled root

	<Directory /home/*/public_html>
		AllowOverride FileInfo AuthConfig Limit Indexes
		Options MultiViews Indexes SymLinksIfOwnerMatch IncludesNoExec
		AddHandler cgi-script .cgi .pl
		Options +ExecCGI 
		<Limit GET POST OPTIONS>
			Require all granted
		</Limit>
		<LimitExcept GET POST OPTIONS>
			Require all denied
		</LimitExcept>
	</Directory>
</IfModule>

ふう，じゅぎょー準備途中でわきみちにそれてばててしまった ……

準備のつづき ……

1700 研究室発．保育所で明日の「新年交流会」，コマまわしの練習． 1810 帰宅．とらめし．晩飯．

[今日の運動]

とらちゃんえくささいず．

[今日の食卓]

朝 (0630): 米 0.7 合．タチの味噌汁．
昼 (1200): 研究室．米 0.7 合．サバ．さつまあげ．ブロッコリー．トマトスープ．
晩 (1900): 大丸地下の点心．ダイコンサラダ．

ぎょーむ日誌 2014-01-16

2014 年 01 月 16 日 (木)