ぎょーむ日誌 2014-09-(21-30)

2014 年 09 月 21 日 (日)

• とらにおこされて， 0550 起床． 朝飯の準備． 朝飯． コーヒー． とらと遊ぶ．
• 0820 自宅発． 今朝は地下鉄 + 徒歩で移動して， 0900 円山動物園着．
• いろいろ動物をみた． とらは本日はカバとレッサーパンダ， それぞれの給餌のようすが気にいったみたい． 帰りに， 何かちかしいものを感じてられるオランウータンのハヤトを見に行ったり．

• 帰りは中央バスの散策バスで． 大倉山ジャンプ台にも立ち寄った．
• 帰宅して昼飯の準備． 昼飯．
• とら昼寝ねかしつけのおんぶうろうろ．
• ぐったり．
• 食品の買いものあれこれ．
• 晩飯の準備． 晩飯． とら風呂． とらおんぶ寝かしつけ．
• うーむ ……
• [今日の運動]
  • ラジオ体操: 0 回
• [今日の食卓]
  • 朝 (0630): シリアル． ヨーグルト．
  • 昼 (1220): スパゲッティー．

2014 年 09 月 22 日 (月)

• とらにおこされて， 0600 起床． いそいでとらめし準備． 朝飯・弁当の準備． 朝飯． コーヒー．
• 0810 自宅発． 0830 研究室着．
• ちょっとばてる．
• 来週水曜日から始まる集中講義の準備をしなくては ……
• ちょっと遅い昼飯．

[がごめそば]

とくに匿名を希望する漂白の料理人氏がやってきたので， 蕎麦な昼飯を食べにでたのだが …… さか田もみずきも開店してなかったので， えりも亭 に行ってみた． 札幌では珍しい太い蕎麦． おいしくいただきました． 料理人氏と会うのはひさしぶりなので， いろいろとハナシをうかがうことができた．

• 準備ぢりぢり ……
• 進捗よろしくないまま撤退 …… 1730 研究室発． 1750 帰宅． 晩飯の準備． 晩飯．
• [今日の運動]
  • ラジオ体操: 0 回
• [今日の食卓]
  • 朝 (0630): 米 0.5 合． シジミの味噌汁．
  • 昼 (1330): がごめそば．
  • 晩 (1830): 米 0.7 合． シジミの味噌汁． サケ． トマト・ナス・タマネギ・パプリカのラタトゥイユ．

2014 年 09 月 23 日 (火)

• 0600 起床． 朝飯の準備． 朝飯． コーヒー．
• 今日は秋分の日だけど昼・夜の長さが等しい …… というわけではないようだ …… wikipedia
• 0810 自宅発． とらと少しミニ大通公園であそぶ …… エゾノコリンゴの果実をやたらとむしりとっているな …… 0950 研究室着．
• 昨日， こちらに掲載しわすれた「がくぜん」:

  R package の help HTML 版を静的に生成する関数の例: http://t.co/yAGAycHCBq こんなに簡単なのか!……がくぜんとしました．私はもっとアホみたいに複雑な方法で生成していました…library(tools) まわり，ぜんぜん理解できていない…

  — 久保拓弥 (@KuboBook) 2014, 9月 22

• ついでに， R 並列処理あれこれをながめる
  • foreachパッケージで、並列化する/しないを綺麗に書き分ける - My Life as a Mock Quant @teramonagi d.hatena.ne.jp/teramonagi/201… ifelse(parallel, `%do%`, `%dopar%`) 二項演算子定義わざ   11:25:59
  • RT @hoxo_m : こんな感じ。

    library(doParallel)
    cl <- makeCluster(detectCores())
    registerDoParallel(cl)
    foreach(i = 1:3) %dopar% {
      rnorm(i)
    }
    stopCluster(cl)
    

    11:30:05
  • RT @hoxo_m : library(doParallel) するだけで foreach も parallel も iterators もロードされるので便利。   11:30:08
  • RT @hoxo_m : @kos59125 こんな感じすかね。

    (function() {
      cl <- makeCluster(detectCores())
      registerDoParallel(cl)
      on.exit(stopCluster(cl))
      foreach～
    })()
    

    11:31:14
  • R の並列処理，よくわかっていないのですが……ちゃんと例外処理とかやらないとメモリリークするようなかんじの議論ですね……   11:33:20
  • RT @teramonagi : @KuboBook これがベストプラクティスかどうかはちょいと自信がないので、 @hoxo_m @kos59125 , @gg_hatano あたりの意見もお伺いしたいところです！   11:37:47
• あとからわかったのだが， 例外処理とかではなく， ゾンビプロセス問題対処のためのようで ……

  sfさんにほめられて光栄です。 / “doParallel関数に直接ワーカープロセス数を指定するとゾンビプロセスが残る件 - 2014-09-23 - sfchaos blog” http://t.co/K0rFSgVMUu

  — hoxo_m (@hoxo_m) 2014, 9月 23

• しごとすすまないうちに昼飯時間に．
• 北大コーポレートカード (大学の立替払用クレジットカード) のごちゃごちゃ web page は http://north.finance.hokudai.ac.jp/~chotatsu/gakunai/index02.html …… 学外からは接続できないというないすな仕様．
• このあたりのどうでもよい作業に時間をとられてしまった． いやはや ……
• さらに「ざつよう撃滅戦」みたいな苦闘 (ばかり) がつづく ……
• おや， みなさんも気に入りましたか．

  Wikibooks の "R Programming" http://t.co/nKvIViGeIl かなり親切で見やすい (コードも彩色されてるし) R の使いかた入門になっているような気がする……

  — 久保拓弥 (@KuboBook) 2014, 9月 23

• けっきょく， 「やらねばならないあれこれ」 はかなり消化できたような気もするけれど …… 来週の集中講義の準備とかはできていない!
• 1620 研究室発． 買いもの． 1650 帰宅． とら坊の遊びあいてをしつつ， 晩飯の準備をぢりぢりとすすめる …… かなりの難事． 晩飯． とらとラジオ体操．
• とら寝かしつけで苦闘 …… ばてた …… 肩の筋肉がいたい ……
• [今日の運動]
  • ラジオ体操: 1 回
• [今日の食卓]
  • 朝 (0630): パンケイキ．
  • 昼 (1200): 研究室． シリアル． 豆腐．
  • 晩 (1840): 米 0.7 合． シジミの味噌汁． ジャガイモ・ニンジン・タマネギ・豚肉の煮物． ゴボウの煮物． ホウレンソウのサラダ． リンゴ．

2014 年 09 月 24 日 (水)

• 0600 起床． 朝飯・弁当の準備． 朝飯． コーヒー．
• 0810 自宅発． 曇天． 0820 保育所着． 0850 研究室着．
• さっさと集中講義の準備をしなければならないんだけど， 進捗がおそい．
• 現実逃避的な細胞生物学データの MCMCglmm あてはめの作業にはまってしまった …… 意外と難物で， グループ差などが大きくて， あてはめがうまくいかない ……
• 昼飯．
• とりあえず， 現実逃避的な試行錯誤は現状の試行錯誤について報告して， 出張授業から帰ってくる 来週末まで放置することに．
• 次の現実とーひは， R のデータ構造かんたん解説のメイルかき:
  • 行列は matrix というクラスがあって，こちらを使わないといけない
  • data.frame は行列ではなく Excel みたいな spread sheet のごときものと考える
  • data.frame は各列が vector クラスのオブジェクトになっていて，その各 vector オブジェクトの type として integer, numeric (実数), factor, character などなどがあるといった構造
  • 列である vector をたばねたものが data.frame なので，data.frame は使わないで vector だけでプログラミングすることも可能
  • 他の言語では list と呼ばれるデータ構造は，R では vector と考えたほうが良さそう
  • vector の他に list なるクラスもあり (ややこしい)，線型な構造であるのは vector と同じだけど，ひとつの list の各要素としていろいろなクラスのオブジェクトをつっこむことができる (これに対して，ひとつの vector には単一のクラスのオブジェクトしか入らない)
  R つかっている大学院生たち …… このあたり，どれぐら理解しているんだろうか?
• 集中講義の準備， いまさらながらぢりぢりと進める ……
• べつの集中講義の書類かきがとびこんでくる …… 履歴書とかそういった情報を大学事務なケイ線まみれな 呪われファイルに流し込んでいくだけの作業なのだが …… 一時間を費やしてしまった． これだけネットワークが普及しているんだから， 大学事務書類なんかも， もう少し生産性の高くなるよう配慮していただけないんでしょうかね ……
• 1720 研究室発． 買いもの． 保育所でとら回収． 1750 帰宅． 晩飯の準備． 晩飯． とら風呂．
• とら寝かしつけおんぶうろうろ …… けっこうばてた ……
• [今日の運動]
  • ラジオ体操: 0 回
• [今日の食卓]
  • 朝 (0630): 米 0.5 合． 味噌汁．
  • 昼 (1200): 研究室． 米 0.7 合． さつまあげ． ゴボ天． ゴボウの煮物． ミニトマト．
  • 晩 (1830): 米 0.7 合． ホウンレンソウの味噌汁． 鶏肉・野菜のいためもの． ゴボウの煮物．

2014 年 09 月 25 日 (木)

• 0600 起床． 体重 69.2 kg． やはり 1 kg ぐらい増えたかな …… とはいえ， カラダがらくになっているかというと， 必ずしもそうではなく …… とらだっこ疲労が肩・背中に残っていたり， 夜中に少なくとも一度は目がさめてしまうような状態が継続している．
• とら坊おきてきて食べものを督促するので， いそいで朝飯・弁当の準備． 朝飯． コーヒー．
• 0810 自宅発． 0820 保育所着． 0850 研究室着．
• ぢりぢり準備 ……
• 1720 研究室発． 保育所でとら回収． 1750 帰宅． 晩飯の準備． 晩飯． とら風呂．
• [今日の運動]
  • ラジオ体操: 0 回
• [今日の食卓]
  • 朝 (0630): 米 0.5 合． 豆腐の味噌汁．
  • 昼 (1300): 研究室． 米 0.7 合． ニシン． ゴボ天． ミニトマト．
  • 晩 (1900): 米 0.7 合． 点心あれこれ．

2014 年 09 月 26 日 (金)

• 0530 「おきるー!」とらにおこされて起床． ちょっとおんぶうろうろしてみたら寝るんだけど， ふとんの上の睡眠は拒否． しょうがないので， 朝飯・弁当の準備． 朝飯． コーヒー．
• 0820 自宅発． 0830 保育所着． 0850 研究室着 …… すでにばてばて．
• 来週の集中講義の準備， なかなか進捗しない ……
• 1720 研究室発． 買いもの． 1750 帰宅． 晩飯の準備． 晩飯． とら風呂．
• [今日の運動]
  • ラジオ体操: 0 回
• [今日の食卓]
  • 朝 (0630): 米 0.5 合． 豆腐の味噌汁．
  • 昼 (1200): 研究室． 米 0.7 合． みそ漬けサケ． ミニトマト．
  • 晩 (1830): 米 0.7 合． 野菜スープ． チンゲンサイ・エノキダケ・鶏肉のいためもの．

2014 年 09 月 27 日 (土)

• 0600 起床． とらもすぐにおきてきた …… とらめし・朝飯の準備． 朝飯． コーヒー．
• 今日・明日はとらとあまり遊べないので， 朝のうちにいっしょに外出．

[JR 北海道バス琴似営業所]

0753 自宅ちかくのバス亭発． 8 時すぎ， 琴似営業所着． 数十台のバスが燃料補給したり， 仕事にでかけたりするので， とらは楽しんだみたい． 0845 営業所のバス停から出発． 9 時ごろ帰宅．

• マンションの 「あき駐車区画とりあいくじびき」 に敗北して， 1020 自宅発． 1040 研究室着．
• 準備がなかなか進捗しない …… しんどい ……

[レゴにあらわれるココロ]

昨晩， とらのレゴを使って， こういうものを作ってみました． 高くて不安定な塔のてっぺんで， 動物たちが何もない空間に足をふみだしてふりーづしている様子 …… 集中講義の準備が終わらないココロお苦しさを表現してみました．

• 昼飯．
• ぢりぢりと作業をつづける ……
• 明日はとらのうんどうかいなので， 作業できる時間はあまりない …… 新千歳空港発は火曜日の朝．
• とりあえず， ホントに最小限の準備 …… という明暗境界線は突破した， かも ……
• 1720 研究室発． 買いものあれこれ． 1750 帰宅． 晩飯． とら風呂．
• [今日の運動]
  • ラジオ体操: 0 回 …… うんどうぶそくな日がつづく
• [今日の食卓]
  • 朝 (0630): ぱん吉の角食． チーズ・ベイコン・トマト．
  • 昼 (1200): 研究室． 食パン． 鶏肉． トマト．
  • 晩 (1830): 米 0.7 合． ポトフ．

2014 年 09 月 28 日 (日)

• 0520 とら泣きおき． 30 分ほどおんぶうろうろしてみたんだけど， ふとん寝はひたすら拒否． あきらめて， 朝飯の準備． 朝飯． コーヒー．
• 0720 表参道までとらバス見物の散歩にでる． 二中公園で少しすべり台とかしてから帰宅． 一時間ぐらい外にいたかな．
• 0825 自宅発． とら徒歩 (ただし今日は急いでいるので，ところどころだっこ) で 0840 保育所着． JR 北海道バス (JHB) の貸切バスに乗って， 保育所うんどう会会場に移動! とらは JHB に乗れて望外のしあわせ， というかんじ ……
• 昨年 は桑園公園で運動会， だったけど本日は天候あやしいということで， 北 9 西 24 あたりにある日新小学校の体育館で． まあ， 予報は外れて結果的に雨はふらなかったんだけど．

[体育館で運動会]

約 100 名の保育園児たちが元気に走り回っていました． とら坊は …… 誰にもよくわからない理由で， 徹頭徹尾・完全ボイコット． あひる組のスペースでぽつんと座ったきりでした． うーむ? 昨年 (1.1 歳) はけっこうちょろちょろ動いていたんだけど ……

• 帰宅して昼飯．
• とら昼寝のねかしつけ．
• その後， 脱力してぐったり． ばてぎみですな ……
• 1720 研究室発． 買いもの． 保育所でとら回収． 1750 帰宅． 晩飯の準備． 晩飯． ラジオ体操． とら風呂．
• とら (2.1 歳) の保育所連絡帳， 運動会後の様子など書いてみた …… そうそう， 翌朝になって， あひる組の集団遊戯としてやった「まつぼっくりがあったとさ」 を自宅で一人で実演してくれました ……

• [今日の運動]
  • ラジオ体操: 1 回
• [今日の食卓]
  • 朝 (0630): 米 0.5 合． ポトフ．
  • 昼 (1320): 寿司．
  • 晩 (1750): 寿司の残り．

2014 年 09 月 29 日 (月)

• とら泣き「おきるー」で 0540 起床． 朝飯の準備． カボチャスープ作ってみたんだけど， 「何だかちょっとヘンな味だな?」 といったものに …… タマネギを入れ忘れた! すまん， とら …… 朝飯． コーヒー．
• 0810 自宅発． 0820 保育所着． 0850 研究室着．
• ぢりぢり準備作業のつづき ……
• まあ， なんとかなるかな …… というあたりで撤退． 1740 研究室発． 1800 帰宅． 晩飯．
• [今日の運動]
  • ラジオ体操: 0 回
• [今日の食卓]
  • 朝 (0630): フレンチトースト．
  • 昼 (1200): 研究室． 納豆巻き．
  • 晩 (1830): パスタ． ラタトゥイユ．

2014 年 09 月 30 日 (火)

• 0020 とら「おんぶー」泣きで容赦なくおこされる …… 30 分ちょっと， おんぶうろうろ ……
• 0520 起床， ちょっとだめーぢが残っている …… とらもすぐにおきてきた． せかされつつ， 朝飯の準備． コーヒー．
• 0710 自宅発， 本日は茨城県出張の第 1 日目ということで …… 0710 自宅発． 2014-09-30 Tue 07:25 0725 JR に乗って桑園発． 0735 札幌で快速エアポートにのりかえ …… 意外とこんでる．
• 0820 新千歳空港着． 朝飯． 0903 茨城空港いき Skymark 790 便 (B737-800) に登場． 搭乗率 3 割ぐらい……? この路線， だいじょうぶなのかな …… 乗客としては， すいていて快適だけど．
• 1025 茨城空港 (航空自衛隊百里基地と共用) に着陸．
  • 茨城空港着。空港ノーガードwifi充実。バス待ち30分。さすがは F-4 ファントムの「聖地」百里基地、展示がいかしてます。奥の迷彩機は偵察用 RF? pic.twitter.com/sLwu6bruPQ   10:52:59
  • 
  • 民間空港からよく見えない航空自衛隊基地でも RF-4 の尾翼が見えたような…御嶽山の写真撮影とかしないのかな？普賢岳噴火のときみたいに。   10:55:28
  • 水戸駅いきバスに乗って発車を待っていたら、偵察航空隊の迷彩ファントム RF-4 (EJ?) が急旋回降下して滑走路に着陸する場面を見れた……平日午前だけど、長いレンズをつけたヒト 10 人ぐらい、滑走路わきの小山を占拠していた。   11:10:19
  • JR 水戸駅 4 番ホームで電車まち昼飯。水戸に来るのは初めてだけど、いったん素通りして特急スーパーひたちでさらに北上する予定。夜には水戸に戻るけど。 pic.twitter.com/y9wl8ez0B5   12:09:49
  • 
• スーパーひたちに乗って水戸発． 1241 高萩着． 駅前に空き地が目立つ ……

• 茨城県北辺のサビれつつある街なのかな …… という側面もあるようだけど (人口減少中)， 2011 年の東日本大震災ではけっこう建物などが 倒壊したようで ……
• 木村さんが迎えにきてくださり， 山奥に隠されている 林木育種センター へ．
• 階層ベイズモデルの解説セミナー． あちこちの森林総研に中継されている…… そして， 林木育種センターのみなさん， けっこうこのあたりのモデリングについて， すでにくわしく知っておられる!
• セミナー後もいろいろ議論 …… 考えてみれば， 森林生態学・遺伝学な議論をするのは， なんだかけっこうひさしぶりのような気がする．
• 晩御飯は那須さん・木村さんといっしょにいただきました．
• 1956 普通電車に乗って JR 高萩駅発． 2044 水戸着． ばてた ……
• [今日の運動]
  • ラジオ体操: 0 回
• [今日の食卓]
  • 朝 (0830): 空港サンドイッチ．
  • 昼 (1200): 水戸駅サンドイッチ．
  • 晩 (1830): JR 高萩駅のちかくの居酒屋 はせ川 でおいしい魚をごちそうになりました． おいしかった!