ぎょーむ日誌 2004-08-13
2004 年 08 月 13 日 (金)
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0830 起床．
朝飯．
コーヒー．
0930 自宅発．
曇．
0940 研究室着．
外は涼しいけど，
かとーオフィス内は気温が高い
(計算機の台数が多いため)．
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樹木モデルの部品について概説した
Components of functional-structural tree models
(Risto Sievönen たちの総説, 2000)
を読む．
いまさらながら，
というかつい先日みつけたばかりなもんで．
えー，
たいへん良くまとまっていて参考になる．
樹木の機能構造モデル (functional-structural model; FSM)
を構成する理想化基本単位 (idealized elmentary unit; IEU)
なるものが提案されていて，
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IEU は樹木を構成するくりかえし単位である
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IEU は隣接 IEU と近傍環境とのみ相互作用する
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隣接 IEU との物質やりとりはその
IEU の構造と状態だけで決まる
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その近傍環境は一様になるぐらいに
IEU は十分に小さい
といった要件をみたすもの．
つまり「植物を構成する『部品』ってそういうものでしょう」
という制約の検討だ．
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ぱいぷ樹木
の部品は IEU 要件にほぼ合致する．
これは偶然ではない．
Sievönen さんは
「こういうシミュレイターがあれば樹木生態学の研究には有用だろう」
という考察から上のような諸条件を導出し，
ぱいぷ樹木もまた同じ方向性から設計されてきたので，
両者は相同性をもつにいたったのである．
まあ，
同時にぱいぷ樹木が彼らの
LIGNUM
などから多大の影響うけている，
ということでもあるのだけど．
一方で，
基礎研究のためではない，
農学など応用むけ樹木モデリング研究では
IEU 要件のような面倒くさい制約は重視されない．
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などと勉強してから，
ぱいぷ樹木論文つづき．
呪われあろめとりーの支配する末端形成の説明は難しい
(というより書いてて理不尽さがイヤになる)
ので，
いったんほうりだす．
じゃ，
何を説明するか．
えーと，
まだまだ書いてないところばかりだな．
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とりあえず「局所明るさ」評価の説明．
これは
「はしょった説明」
を構成するのが比較的ラクだな，
とぢりぢりと匍匐前進．
1300 ごろ，
光捕獲の短縮な説明と光合成まわりの書き直し，
ひとくぎりつく．
すごく圧縮してるつもりなんだが，
じょじょにかさばりつつある．
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昼飯．
あ，
雨がふってきた．
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今日は昨日よりさらに静か，
というかんぢだ．
釧路どたばた沈黙．
苫小牧沈黙．
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などと書いた数分後に釧路雑用わりこみ．
そして苫小牧ボスからメイルいただく．
油断大敵．
ちょっとちがうか．
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釧路雑用のほうはてきとーに．
苫小牧のほうはそうはいかないので緊張する．
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とりあえず Dell 機で飽差 (VPD) ぬきモデルの推定計算．
これは明朝までには終了するだろう．
「ある日の降水が何日ぐらい尾をひくか」
で変化する AIC (モデルの良さ) 変化の作図．
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作図分担案アップロード．
お返事かき
……
で，
一件落着か?
時刻は 1600 前．
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ぱいぷ樹木論文つづき．
まだ途中がすかすかすかすかなんだけど，
Functional design of PipeTree
節の最後に位置するぱいぷ束のくたばりかた
副節を書いてみる．
これは局所資源量だけで決まる，
というもの．
そしてここでも当然ながら
「再帰」的参照 (recursive reference) が必要になる．
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ぱいぷ束死亡もてきとーにひとくぎりついてしまったか?
夕方になってまた活性化してる釧路どたばた．
私はこれに関しては wiki 記録者に徹しているので気楽なもんだ
……
しかし wiki 上の記録も現実のごたごたを反映して，
少しばかり錯乱してきたのでりすとらする．
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1740 研究室発．
クラーク会館地下の
理髪店
で散髪．
1840 同発．
雨．
1930 帰宅．
体重 72.8kg．
晩飯．
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[今日の運動]
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[今日の食卓]
- 朝 (0830):
食パン．
タマネギ・ハクサイ・ニンジン・ジャガイモ・
エノキダケ・豆腐のカレー (スープ化)．
- 昼 (1340):
研究室お茶部屋．
食パン．
- 晩 (2030):
米麦 1.0 合．
ナス・ピーマン・シイタケ・卵の炒飯．