ぎょーむ日誌 2000-11-08

2000 年 11 月 08 日 (水)

• 0640 起床． 昨晩は 2230 ごろに寝た． 途中でいっぺん起きたけどよく眠れた． いまのところ， 時差ボケ解消．
• シャワー． ひげそり． 朝飯・弁当の準備． 朝飯． コーヒー飲む． 時間あるんで， のんびりと．
• 0808 自宅発． 晴れ． うん ? 環七に垂れ幕． 11 月 19 日東京国際女子マラソン． 国立競技場←→平和島， か． へぇー， この道がコースになってるんだ， と思いつつ平和島を横断． 0825 東京モノレイル流通センター発． 浜松町の気温 16 ℃． 0840 研究所着．
• 昨日のぎょーむ日誌をいまごろになって書く． まぁ， 書いておかないと作業の記録が残らんし． あ， 絵や写真がなくてサビしい．
• 朝からやかましい． どうしてあんなに気色悪い妖怪じみた声で 笑えたりするんだろうか． 本人は自覚ないんだろうな．
• さっさと「小川本」の 分担章の直しにかからなくては …… と思いつつ， 昨日の午後の作業の続きをやってしまう． voxelight あらため evsion なる 名前にされてしまった 開空度計算ライブラリーの見直しである．
• 今回は「メモリーどか食い」する voxel 三次元地図を少しばかり痩せさせる改造． 瞬間最大風速的に メモリー使用量が増大することがある， と気づいたもんで．
• gridworld あらため voxelmap というクラスは， PipeTree は ofr_simulator の樹木なんかから 「こーいう円筒生成してくれ」 とか 「葉群はこんな形で」 という注文をうけると， それを voxel 化して voxel_buffer に貯めこんでおく． そういう作業が一段落すると， これら simulator から 「以上，map に配置して」 という命令が来るんで， buffer から map に転写が行われる． この転写が終わった瞬間には buffer と map の両方に 数万-数百万個の voxel が同時に存在するんで， メモリー使用量が増大するのである．
• 解決策はとても簡単で， voxel → map に一個の voxel を転写したら， それは buffer からは削除しなさい， とするだけである． ただし STL コンテナーの特性は 考慮しなければならない． voxel_buffer の実体は vector<voxel> なんで， アタマではなくオシリのほうから 削っていくと速いのである．
• さーて， 改造してみると …… うーん， PipeTree 20 本からなる樹木集団では メモリー使用量が劇的に減った， とは実感できんな (もともと 10 MB も使ってないから)． まぁ， 理屈の上では確実に減ってるはずなんで， 小川 24ha 20000 本のような大規模計算では 有用だろう， ということにしておくか．
• こちらのフロアーの事務の人から 毎月 Excel のファイルがメイルで送られて来る． 座席表とかいうやつである (どうやって Excel で作ってるのかな?)． 私には読めないし， 120KB ぐらいあるファイルなんで …… Excel の呪われ具合について簡潔に説明し， PDF ファイルとかネット上にアップロードするような 別の手段も考えてはいただけませんか， なるメイルを送ってみる．
• 今度はシーヴァンスにいる NASDA の事務の人から． 富士山麓統計学セミナーの 出張申請が却下されそうなんで， なんか作文してくれ， とのこと． てきとーな文章をさっとでっちあげて， こんなんでどうでしょう， と返信してみる．
• 蛇足ながら …… 右隣りの区画でやかましくしてるのは 科技庁系の官僚殿たち & 天下りのおじーちゃんたちであり， 上で言ってる事務の人たちはそれに含まれていない (そもそも所在位置も異なる)． いかに無礼にして傲岸不遜な私であっても， いつもお世話になってる事務担当の方々には きちんと素早く礼儀正しく対応しているのである．
• …… とかやってると， 昼どきになり， 腹もへったんで弁当を食うことにする．
• ちょっとまにあっくな文書発見． 有害な csh プログラミング なる解説． csh の呪われスクリプトと言えば (私自身もかつては書いてましたが) …… やはり GMT のインストーラー (らしきもの) が近ごろ見た中では凄かったな． とはいえ， あれはどんな言語で書かれてもヒドいままだろう．
• 私も使ってる東京三菱のネットバンキング． プログラムのつまらんバグで手数料とりすぎ． やれやれ． ところでこういうおカネ出し入れシステムは どんな言語で記述されてるんだろう．
• Gnuplot の 3.8e beta 版が 出回ってる らしい． 三次元描画とインターフェイスの改良を 重視してるのかな．
• 午後になって， 先日提出した出張報告の書類が差し戻されてくる． 「簡単すぎる」 ってのが良くないそうで． しょうがないんで， 例の樹木モデル会議の様子を複雑怪奇に 報告する文書をでっちあげる． 今日はこんなのばかりだな． だれが読むというのだろうか …… 書類のハンコおす欄をみると 係長→代理→課長→次長→部長 まであるな． おそるべし官僚機構．
• PipeTree の「暗所実験」の結果について， 甲山さんの疑惑があるようなので， 身の潔白を明かすために 資源配分コードなど見直す． 問題ない， ように見えるんだけど …… しかしながら PipeTree というのは 1/10 どころか 1/100 まで光を カットしても (かなりみすぼらしい形態ながら) まだ生きてるんですよね． ちょっと変．

[1/100 光量の暗所で生きる]
枝はすぱすぱ落してしまう
んだけど …… まだ生きて
成長してるパイプ樹木．プ
ログラムの間違いではない，
と思いたいんだけど．

• いろいろといじってると core 吐きエラー． げ． まだこんな原始的な bug が残ってたのか． gdb に core を食わせる． えーと …… あ， なるほど． 親パイプがすでに死んでる子パイプに 「あなたの親の ID は?」 とお尋ねするとマズいわけだ． pipetree を最初から動かしてるぶんには， 死んだパイプも保存されてるから 問題ないけど， いっぺん「ファイル出力せよ， ただし死んだパイプはいらん」 として外に出してから， もいっぺんそのファイルを読みこんで パイプ集合体たる樹木個体を生成すると …… とーぜんながら どこにも親パイプはみつからんね．
• ちょっとマヌケな応急処置をしておく． PipeTree においてはもはや パイプ間の親子関係は重要ではなくなったので (パイプ親子の断絶 !)， この程度のごまかしでもよい． というか， いまのモデルなら親知らず子知らずでも ぜんぜん差し支えない．
• 甲山さんから 「以前のやつはもうちょっと 個体間の樹高に差が出てたのでは」 なる御指摘． うー， あれは上高森遺跡な計算で， かなり無理矢理樹高に差がつくようにしてた． そういう小細工やってもしょうがないんで， PipeTree りすとらということで モデルの大幅な単純化をやってるわけじゃないですか．
• 「PipeTree 集団で個体間の樹高に差がつかない」 要因をいろいろと列挙してみる．
• 書くだけでは信用されんだろうから， たとえば非同化部 (つまり葉っぱ以外) の 維持コストを現在の 100 倍にしてみて 樹木集団の計算やってみる． おお， やっぱりちょっと差がついたな． 面白いのは太ってる樹木ほど背が低いところである． これは不思議でもなんでもなくて， 林分 (樹木集団) のはしっこに位置する個体は 横方向の枝が良く伸びるんで 資源がそちらに巻き上げられて， 高さ成長は目減りしているのである．
• 多少それらしい形態の樹木を生成してみせるとはいえ， 現状ではこの程度のモデルなのである． 簡単に言えば 「樹木という固着性生物の高さなる量は どうやって決まるのか?」 という問題に帰着できるので， 改善案はいろいろと考えられるが …… ここは発注者のお手並拝見． センスを感じさせる対策が示されるとよいですね．
• PipeTree の生物学的側面については 甲山さんに悩んでもらうとして， 計算プログラムとしてはまだまだ 改善の余地があるな． いまは「個体は pipe の寄せ集め」という モデリングだけど， パイプ樹木においても segment による 樹形管理を基本とし， pipe なる抽象概念はその上に「乗っかってる」 ようにすべきだな．
• 引続き甲山さんのメイルのやりとりで， 私としては 「肥大成長については (集団動態実験では最初の小さな差が拡大するってのが ふつーじゃないの， という) ご指摘のとーりになっているんですけど， ただ一本の (個体内パイプ間「資源獲得競争」において有利な) 垂直パイプにだけ依存してきまる高さ成長に関しては， 個体間で差がついてない」 という状況なんだから， 「個体の全生産力の大小が高さ成長に影響する ようなサブモデルを考えればよいわけです」 というところまでヒントを出す． うーん， われながら親切．
• アメリカ政権は共和党のものになったようである． さてどうなることやら． 計算機関係でいえば …… げいつ君はうかれてるんだろーな (司法省あいての裁判が有利になる)．
• 1805 研究所発． 浜松町駅の本屋 dan に寄る． 1842 東京モノレイル浜松町発． 1930 帰宅．
• 晩飯食いながらラジオのニュース聞いてると， アメリカ大統領選挙は 「決戦の地」 フロリダの開票結果に物言いがついて， ただいま協議中とのこと． わけわからんな．
• 「統計学的有意差」 こそが この世でもっとも重要な真理だと狂信してる 生態学者 (の一部かな?) は今回のような 接戦の選挙はどう評価するのであろうか．
• 炊飯器のソケットが不調なので， ニッパーでその部分を切り離し， 浜松町の電器屋で買って来た ネジ組立式のもの (90 円) につけかえる． ニッパーやドライヴァーを持ってない人は こういうときにどうするんだろう． 電器屋に修理にだすのか． その場合， 「部品ごとつけかえ」とか いって電源ケイブルが まるごと交換されてしまうんだろうか．
• なんかいろいろやらねばならんのに， 図書館から借りてきた本をてれてれと読んでしまう．
• 苫小牧演習林の大規模な伐採作業は 院生軽傷 2 名 (ひっかき傷・切傷) で大過なく終了したそうである．
• 早起きがたたって眠い． 仕事がはかどらん．
• 今日の食卓
  • 朝 (0720): 米 0.6 合． キャベツ・タマネギのカレー炒め． 豆腐の味噌汁． どちらも昨晩の残り．
  • 昼 (1220): 弁当． 米 0.8 合． キャベツ・タマネギのカレー炒め．
  • 晩 (2000): 米 0.7 合． 豆腐・ネギ・タマネギ・エリンギを煮たもの． 味付けが醤油・砂糖でなんとなく すきやきふう．