ぎょーむ日誌 2000-10-11

2000 年 10 月 11 日 (水)

• 0750 起床． ありゃりゃ． 目覚しの調子が悪いんだろうか． まぁ， 間に合うだろうけど．
• えーと， 昨晩は 2230 ごろにいっぺん寝て 0030 ごろ起床． それからまた眠れなくなって 0500 ごろにまた寝たかな． 体内時計， どうなってるんだろうね．
• 朝飯・弁当の準備． 朝飯． ラジオのニュース． 日本人がノーベル化学賞． 伝導性のプラスティック素材ですか． ふーん． コーヒー飲みつつ．
• 0815 自宅発． 晴れてるのか曇ってるのか． うー， 眠い． 0832 東京モノレイル流通センター発． 浜松町の気温 21 ℃． なんか気温高いな． 0850 研究所着．
• 小川モデリング ofr2000 も佳境に入りつつあり， コードをだーっと書くことも多くなってきた． そこで BookPC につないでる鍵盤を OKI の Mini Keyboard II (MKII) から PFU の Happy Hacking Keyboard (HHK) に取り換えてみた．

[小鍵盤二枚流]
上が OKI の MiniKeyboard II で下が
Happy Hacking Keyboard．どちらも小
さくどちらも US 配列で [Ctrl] が [A]
の左にある．えーと，上が 10K 円で
下が 30K 円 (買った当時の値段)．

• BookPC に MKII つないで使っていた理由は 「トラックポイントがついてて便利だから」． 私はマウスなんかがあまり好きではないもんで． キーボードから手を放すのが面倒なのである． その点， この ThinkPad ふうな MKII は良いんだけど， いかんせん (値段は安くはないのに) 造りがちゃちで 押し込んだキーが戻らなくなったりして， たくさん打つと入力間違いが増える．
• MKII はひっかかりつつ入力するかんじであるのに対して， HHK のほうはさらさらと流れるように 打鍵できてしまう． とてもキモチいい． 申し分なし． 高級鍵盤です (ただし値段が高い理由はこれ一台で PC・Macintosh・Sun の 3 アーキテクチャーに 対応してるためでもある)．
• マウスも持って来てつけてみたんだけど， 壊れてるらしくてちゃんと動作しない． しょうがないんで持ち帰る予定だった MKII のトラックポイント機能だけを活用することにした． すなわち HHK で打鍵し ポインターを動かすときは MKII に手を伸ばす， という図式である．
• ネット上でノーベル賞関係のニュースなど読む． 伝導性ポリマーの研究ってのは すでに 20 年前のものか． どうでもいいが この賞って最近は老人に与えられることが 多いな． たとえば 今回の物理学賞・医学生理学賞なんて 6 人全員 70 代だし． 化学賞も全員 60 代以上． それを考えると利根川進なんて 比較的若いうちに受賞したわけだ． あ， そうか． 当時は分子生物学という学問が 若かったのだ．
• 分子生物学に限らず 科学はしだいに老化しているのである． いろいろな意味で． ひとつに 老人が支配する世界になるんだろう， という気がする． とくに ここにいるとそう思う．
• じじい支配への 私自身の対抗策としては 「金のかからない科学者になる」 というぐらいしかないな． モデル屋やってるのも free のソフトウェアしか使わないのも 偶然というだけでない． 建造費だけで 72 億円の 阿房宮な計算機など使った研究など 誰がするもんか (蛇足注： 始皇帝が造営を命じた阿房 (傍?) 宮は 阿呆の語源という俗説あり)．
• ともかく金のかからない小川モデリングの続きだ． Forest-Quadrat-Tree の結合はできたけれど， それぞれの中身がすかすかすぎて 今のところパラメーター推定にも使えない． えーと， サブモデルの plugin モジュールを 読ませるようにして， 地形計算を呼び出す関数を書いて ……
• あまり進捗しないうちに午前中終わる． 腹減ったんで昼飯の弁当食べる．
• 札幌市から国民健康保険の残金納付しろ とうい執拗な督促に屈っして支払いにいく． 1240 研究所発． まず近くの銀行 ATM で金おろす． つぎに大門の交差点をわたる． まっとうなツトメ人ふうの人が 群をなしていますな． 浜松町郵便局で また 10 分ほど待たされる． で， 25200 円が北海道に飛んでいく (心象的には)． これは今年の 4-5 月分である． (この期間は札幌に住んでいたから)． 1300 研究所にもどる．
• 札幌には 2 年 2ヵ月いたわけだが， その間に国民健康保険料として 合計 60 万円近く支払ったことになる． ま， 私の場合， 直接支払わなければならなかったんで 「たくさん取られた」 感あるわけですが．
• その間に医者にかかったのは …… 苫小牧演習林で 野外調査のお手伝いしたときに ウルシにかぶれたんで， 地環研前の中野医院 (皮膚科) で 10 秒の診察うけて 1 本の塗り薬チューブもらった ぐらいなんですが．
• いや， 医者に行けば行くほどおトクです， というモンでもありませんけどね …… しかし， 医療費増大したら ますますこういう負担が増えるんだろうか． ヒトのメンテナンスには金がかかるなぁ．
• ちょっと迷ったんだけど 小川のシミュレイター系のパラメーターも 推定系の Parameters クラスを流用してみる． こうすれば Plugin モジュールが すっきりとする． しかしこの Parameters クラスってのは 最尤推定に最適化してるんで， ちょっとごてごてしてるんだよね． たぶん将来的には 単純化した Parameters を基底とする MLParameter クラス， というふうに分離したほうがよさそう．
• …… と思ったんだけど， 現状ではやはりあまりにも 最尤推定用に偏りすぎている構成だ． 改造がたいへんそう． ちょっと やりかたを変えよう．
• あまりカッコよいやりかたではないんだが …… 必要な値だけ並べた vector<double> を Parameters に提出させて， それを太さ-高さ換算計算関数に 渡すことにする． そうするとシミュレイター系の Tree クラスからも 同じ型の引数を使って 換算関数を呼び出すことができる．
• ただし速度は落ちる． 全 24 樹種の d-h パラメーター推定するだけで 76 秒もかかっている． これは BookPC (Penutium III 733MHz) で計測した値なのである． 遅すぎる． 最尤推定やってるから遅い， というのと私のコードがへっぽこだからノロい， というふたつの問題がある．
• ポインターで渡せば速くなるかな …… しかし ( *parameter )[ 0 ] みたいな書き方は見苦しいので parameter->at( 0 ) と書こうとしたところ， インストールした lib_stdc++ では at() 関数が 定義されてないとわかった． at() って標準じゃなかったのかなぁ．
• ポインター渡しにしても 同じ時間かかるか． ということは vector 複写の回数が減っていないな． 参照渡し ? いやそれができない状況なんで …… いやいや， ちょっと待て ! もとの Parameters クラスに vector 保持させておけば 参照渡しが可能か． 試してみよう．
• おおっ!! 計算時間が 76 秒から 34 秒に短縮された! わーい． えーと， 太さ-高さ換算の尤度関数に渡しているのは Parameters と Sample なんだけど 後者はすでに参照渡しにしてるから， ここはもう速くならないな． 参照渡しでコードもすっきりしたし．
• さーて， Tree クラスから Plugin 関数を 読めるようにしていく． ああ， これでようやく 「エスティメイターとシミュレイターで 同じ dynamic loading 関数を共有する」 が実現できそうだ．
• と思ったら「小川本原稿直せ」郵便が送られて来た． みょーに分厚い封筒． ああ． ちなみにこれは ofr1999 という ヴァージョン (?) のモデルについて 紹介しているのである．
• なんか説明が足りないとか考察が足りんとか …… さらに 他の章との関連も考察しろ， と． 封筒が分厚いのは他の章のドラフトも 含まれているからであった． 一冊の本にするには 当然の要求とはいえ， これを読まんといかんのか． とほほ． 何しろ私などは一番「下流」の シミュレイションねただからなぁ．
• しかし「科学」の小川シミュレイター解説を 書かねばならぬ段階で 良質な資料がまとめて入手できた， とも言える． えーと …… 「お互いの内容について， いろいろと連絡とりあっていただけると ……」 「できれば年内にはもう一度 Springer に ……」 とゆーことは …… 「急がなくてよい」 そういうことですね． そうに決まっています． ええ， そうですとも．
• …… とういことで， すでに 〆切が二週間後にせまった「科学」解説を優先し (つまり 今やってる ofr2000 の作業を続行する ということ)， 「小川本」についてはそのあとでいいや …… ってホントに大丈夫かな ?
• 帰宅可能時間まで Tree クラスから plugin モジュール関数を使えるような コードを作りこんでいく． 1750 研究所発． 新しい椅子を買ってからというもの 自宅で仕事するのがすごく快適になった． ThinkPad しか使えないんで 計算力の点では難があるけれど， それ以外では大森の我が家で仕事するほうが よほど快適である． 1806 東京モノレイル浜松町発． 1847 帰宅．
• 晩飯食って， ぎょーむ日誌に鍵盤話を のんびりと書いたりする． 自宅では ThinkPad560E についてる キーボードを打つことになる． このサブノート PC の鍵盤， というのが またデキが良ろしいのである． かなり快適で官能的． しかもトラックポイントつき．
• 小川モデルの Tree たちに 新たな装いを付与するコードが じりじりと ……
• 今日の食卓
  • 朝 (0800): 米 0.6 合． チンゲンサイと卵を炒めたもの．
  • 昼 (1220): 弁当． 米 0.6 合． チンゲンサイと卵を炒めたもの．
  • 晩 (1930): スパゲッティー． ニンニク・トウガラシ・タマネギを 炒めたソース．