ぎょーむ日誌 2018-10-(11-20)

2018 年 10 月 11 日 (木)

• 0600 起床．
  • RT @bearloga : Other than querying Hive and offloading the Stan model MCMC to our computing cluster, I did every part of this report inside of RStudio IDE. The whole report was created with R Markdown and tidyverse R 📦s by @xieyihui @hadleywickham and many more. R is so lucky to have @rstudio ! twitter.com/bearloga/statu…   09:30:12
  • RT @TwTimez : pic.twitter.com/BgfPMqqaVC 【TwTimez】 RTの勢い順19位のツイートです。 時速1,007RT www.twtimez.net/now/now2018101… @cicada3301_kig ニューエクスプレス津軽語 第1課「はじめまして」…   10:33:41
  • RT @fj197099 : 普天間は「世界で一番危険な飛行場」とされるが、それを統計的に支えるデータは何もない。単に米国のラムズフェルド国防長官（当時）が印象論として漏らしたとされる（事実か分からない）言葉が世間に広まっただけである。実際の普天間の事故は、この20年ほどで2004年のヘリ墜落の一件だけだ。   10:52:50
  • RT @ShiveringElect : キングジムのマウス型スキャナー、クソ便利。 手書きの図とか、本からの図の引用が楽！ 活字を認識して、文字としてもコピーできるから、文献を引用する時も長文を打ち込まなくて良い！ pic.twitter.com/hCqAti251g   12:55:55
  • 生態学会さーば雑用…新さーばでは Dovecot で IMAP なメイルサーバが設定されているのですが…どうもメイルクライアントソフトウェアが OutLook 2016 だと，なんだか挙動がかなりヘン…という事例が２件ほど．とりあえず「メイラーかえてください」と要請中．さてさて，どうなることやら…？   14:44:13
  • 先日も引用した blog.stata.com/2016/11/01/int… を，またカンニング… Posterior = Prior ✕ Likelihood P(θ|y) = P(θ) ✕ P(y|θ) P(θ|y) = Beta(α,β) ✕ Binomial(n,y,θ) P(θ|y) = Beta(y+α,n−y+β) 共役事前分布のありがたみが…（こういうときだけ conjugate prior を称揚してみる）   15:01:44
  • RT @takehikohayashi : 江口哲史著『自然科学研究のためのR入門 再現可能なレポート執筆実践』をご恵投いただきました！オミクスデータ解析の章などもあり激しく俺得でございます。再現可能なレポート作成は研究上のミスコンダクト防止の観点からももっともっと広まって欲しいので本書を広くオススメしたい次第です。 pic.twitter.com/6vlSkxUrBu   16:12:27
  • RT @nico2shogi : 【第31期竜王戦 七番勝負】 第１局初日 10時のおやつ ・羽生善治竜王「アップルパイ」 ・広瀬章人八段「洋梨のムース」 ▼視聴 live.nicovideo.jp/watch/lv315581… pic.twitter.com/jZ4h52iopo   21:20:54

2018 年 10 月 12 日 (金)

• 0600 起床．
  • "朱鷺の杜(IBIS)ブログ" (赤穂さん) 機械学習の数理など ibisforest.blog4.fc2.com/blog-entry-146…   13:58:08
  • RT @hankagosa : おおおお、stan-book リポジトリができとるがや！！（びっくりしすぎて名古屋弁） github.com/stan-dev/stan-…   14:01:41
  • 今日はひたすら事務書類作りとか、事務作業の準備とか、学会事務局へのご説明とか…そんなかんじで終了。えーと、帰宅したら夕食の麻婆茄子づくり…   17:14:01

2018 年 10 月 13 日 (土)

• 0600 起床．
  • アーサー・フェリル「戦争の起源」筑摩書房（ちくま学芸文庫）teacup.ブログ navy.ap.teacup.com/book-recommend… "…重装歩兵の密集方陣戦術をとった理由…それ以上の知恵がなく、ペルシアから学べる時代になった時点ではすでに社会に定着し変えようがなかったからというのがこの戦術をとった理由とまで言い…"   10:12:08
  • Stan on the web! (thanks to RStudio) - Statistical Modeling, Causal Inference, and Social Science andrewgelman.com/2018/10/12/sta…   10:26:27
  • Rstudio Cloud rstudio.cloud/project/56157 トイウプロジェクトが準備されていて，だれでもすぎに RStan の例題を試すことができますよ…というお知らせのようで…たしかに，かんたんにできた（いまはすこしこ混んでる？） pic.twitter.com/8TL8mJ2ObQ   10:32:17
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  • "トイウプロジェクト" → "というプロジェクト"   10:42:10
  • さきほど紹介した Rstudio + Stan な rstudio.cloud/project/56157 そもそもソースコードが Rmarkdown になってて knit したらドキュメントが生成された…なんなの，このヒトたち…（よい世の中になりましたね） pic.twitter.com/mOEQwUTeWe   10:51:36
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  • RT @u_ribo : textlintr、ユーザが自由にルールを追加できるようになったので、実用性が増したのではないでしょうか（ヤッタネ） github.com/uribo/textlintr pic.twitter.com/ZTAAOkklfm   13:49:16
  • こういう，いんちきっぽい作図に一日をついやしてしまった…しかも，まだまだ未完成）…時間がかかった理由は R とその作図のやりかたを，かなり「ど忘れ」していたため．いやはや，長いりはびり作業になりそうですね… pic.twitter.com/qfos3G4yOl   18:27:53
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  • ぼーい先生たちは、お友だちと楽しく遊んだり、夕食を食べていたもよう… pic.twitter.com/XcNF7sbMQb   18:34:15
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2018 年 10 月 14 日 (日)

• 0600 起床．
  • 今日も札幌市中央図書館へ… pic.twitter.com/eGqSXsVm7p   11:06:01
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2018 年 10 月 15 日 (月)

• 0600 起床．
  • RT @ringoame8200 : 来月刊行予定の『P値 ―その正しい理解と適用―』の著者である柳川堯先生によるｐ値の解説論文。 www.jstage.jst.go.jp/article/jjb/38…   09:08:25
  • RT @goeland_argente : P値 その正しい理解と適用 / 柳川　堯(著/文)島谷 健一郎(編集)宮岡 悦良(編集) www.hanmoto.com/bd/isbn/978476… @hanmotocom   15:50:12
  • "p 値は臨床研究データ解析結果報告に有用な優れたモノサシである" www.jstage.jst.go.jp/browse/jjb/38/… "重鎮と目される医師に誤出題であることを説明したが，理解してもらえずに愕然とした．解答枝 e が正解でないことを理解するには統計的基礎知識を必要とするが，彼らはその知識を持ち合わせていなかった" pic.twitter.com/MhDgFPZLAn   15:58:42
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2018 年 10 月 16 日 (火)

• 0600 起床．
  • RT @Stratolaunch : We are deeply saddened about the passing of our founder, Paul G. Allen. He was a visionary who inspired us all to dream big. pic.twitter.com/5S1Dy1FY6P   08:52:29
  • RT @NYCenglessons : つまるところ畜産業は地球の環境と人口を考慮すると持続不可能なので、肉を食べるのをやめようという運動は国連でも静かに広まっています。アフリカの貧困問題に対処しているBill Gatesも肉の代替品を推奨しています。 twitter.com/Tamejirou/stat…   16:02:32

2018 年 10 月 17 日 (水)

• 0600 起床．
  • RT @_RankingNews : <ステルス戦闘機>ハリケーン直撃で大量に大破か 米国｜毎日新聞 headlines.yahoo.co.jp/hl?a=20181015-… 【ワシントン会川晴之】米メディアは14日、米空軍のステルス戦闘機F22がハリケーンの被害を受け、少なくとも17機が大破した可能性があると伝えた。10～12日に南部を襲った大型ハリケーン「マイケル」が、F22が… pic.twitter.com/tMShhRpQt1   09:18:25
  • RStudio 1.2 では Stan 関連の自動補完などが追加…とのこと． twitter.com/rstudio/status…   09:21:45
  • 今日も朝から生態学会さーば作業… pic.twitter.com/L20bOrKkKz   10:28:02
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  • 二項分布な統計モデルの尤度・事前分布・事後分布，dbeta() で作図…いやはや，じつは昨日の夕方，この作図プログラムがほぼ完成していたのですが…突如！…前兆ナシの「アタマがおかしくなる」状態になって，自分で書いたコードが理解できず「お，直さなくては…」とあせって，ますますぼろぼろに… pic.twitter.com/sC8k3ffs8Q   14:53:40
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  • （承前）ついさっきまで，順調に R コーディングしていたのに，自分で何を書いているかわからなくなり，「ともかくコードの復旧を」とあせるほど，何をどうなおせばいいのか，わからなくなる…不思議な状態．こういう「アタマがすごくヘン」状態だけでなく，日々，記憶なんかもトビぎみで…いやはや…   14:57:19
  • 一昨日にも紹介しましたが…二項分布の共役事前分布であるベータ分布 ja.wikipedia.org/wiki/%E3%83%99… こういう授業用の例題としては，なかなか便利ですね．自分のデータ解析では「ベータ分布だけ」では…なかなか難しい場合が多いような気も…一様分布（←これまたベータ分布ですが）を濫用してばかり…   15:03:33
  • ちょっと集中を要する作業が，幸運にもひとくぎりついた…その直後に，また学会さーばのよくわからない挙動にかんして，「なんとかしてください」要求メイルが．人生はままならぬものですなぁ…   15:09:42
  • RT @turingpattern : 日本人のノーベル賞受賞は、基礎科学への支援を訴える重要な機会で、SNSでも、それを意図した研究者のコメントをたくさん見かけます。 ですが、ご注意を。 言い方によっては、こちらの意図とは逆の効果になってしまう。 研究費はばらまけ、とか、結構やばいNGワードです！ www.fbs-osaka-kondolabo.net/blog/baramaki pic.twitter.com/VmVjz2jOiD   15:25:18
  • RT @NaoyukiKatoh : アップルII用の3DCGソフトを買ったときは、当時連載中だった半村良さんの『虚空王の秘宝』に登場する巨大宇宙船（宮武一貴がデザイン）を立体（ワイヤーフレーム）で入力するため、まず僕が方眼紙に三面図を描いてその座標をリストにし、友人が読み上げて、妻がキーボードから数字を入力する分担作業 pic.twitter.com/CdWzjq27Gg   15:38:24
  • いまさらながら IMAP の勉強をしなければならないことに…まあ，こういう勉強はやっても…まあ，許容できるのかも．Wikipedia の解説 ja.wikipedia.org/wiki/Internet_… 簡単でいいなあ… pic.twitter.com/LHGkf3MKj9   15:51:49
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  • 生態学会さーば，どうにもわけわからんので（どういう状況かも，いまいち判然としない）…maillog みながら，「とりあえず」/etc/init.d/amavis stop してみる（/var/log/maillog ながめつつ）…   17:06:47
  • ぼーい先生ねかしつけの「西遊記」を読んで…またまた生態学会さーばの「なんとかしてください！」メンテナンス．本日のわけわからん発見としては amavisd というウイルス検知を「止める」とメイルが配送されない…というもの．まあ，そういう仕様なのかな．ちょっと，とりっきーすぎてイヤだな… pic.twitter.com/i8Kv6ZduFH   21:29:06
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  • RT @youchan_togoru : 石原藤夫さんより『Hard SF Labolatory』 Vol.151～153が届きました。海野十三研究すごいぞ！！　これ同人誌なんだろうかと思いました。ページをめくっては「うああ」とか「ぎょええ」とか声を上げておりました。 pic.twitter.com/L6zN788ViZ   21:34:13

2018 年 10 月 18 日 (木)

• 0600 起床．
  • RT @IPBES : Article in  @PNASNews  says 6th mass #extinction occurring too rapidly for evolution to keep pace. Next 5 decades of mammal loss will require est. 3-5 million years for #biodiversity recovery www.sciencedaily.com/releases/2018/… pic.twitter.com/p6sA78DyFp   09:20:35
  • 生態学会さーば関連のメイルがくると，うつうつとした気分になるので，とりあえず朝はメイルを見ないことにしている．今朝は，とりあえず無問題だったようで…Amavis 止めたら配送も止まる…というのが，昨晩の実験で得られた「危険な」成果． pic.twitter.com/F3WNncPCkn   10:17:58
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  • RT @NatGeoMagJP : 「月旅行」を計画している米スペースX社のロケット打ち上げです。(Photo of the Day) #ナショジオ #photography #写真好きな人と繋がりたい #写真撮ってる人と繋がりたい ow.ly/WF2g30mhcG4   13:08:31
  • RT @Kyukimasa : やはり謎な宇宙からの訪問者オウムアムア www.quantamagazine.org/interstellar-c… 細長い形で自転してるのに分解しないので岩石質と推測→太陽接近時に軌道変化した→彗星のような噴出と推測→分解もせず尾も観測されなかった。 軌道計算すると故郷の恒星系の候補は4つ→しかし軌道はどの恒星からも2光年離れてる。   13:11:51
  • 遠隔地にある某事務局の OutLook 設定にくるしんでいるのですが（もー，やめたい！）…とりあえず，「こういう解説もあるよ」と教えていただきました… univetech.com/outlook-2013%E…   13:13:23
  • 学会さーばぎょーむ…あれしてください・これしてください指示でアタマがごちゃごちゃしてきたので…とりあえず info というアカウントを作り直してみる．いま調べてみたんだけど $ su info This account is currently not available. と返答する状況にある…ことに気づいた．さてさて…   13:51:26
  • 生態学会さーば雑用．どうしても info というアカウントが修理できないので，新しく別アカウント作る… useradd -s /sbin/nologin newXX echo xxx | passwd --stdin newXX # /etc/dovecot/passwd に追加： newXXX@mail.esj.ne.jp::{HMAC-MD5}e6e843588c[ぐちゃぐちゃ文字列] …とりあえず通信できた…   17:03:37
  • RT @utnmy63 : 水と塩だけでスマホを充電できる防災用バッテリー。マグネシウムの化学反応で充電。提供価値を保存期間の長さにおくことで、リチウムイオンバッテリーと差別化している。防災とかの “万が一ニーズ”に着目しているのが秀逸だと思う。9800円。 #CEATEC2018 pic.twitter.com/DeqxMziIHd   18:27:28

2018 年 10 月 19 日 (金)

• 0600 起床．
  • 生姜を買い忘れたので、生姜なし煮魚。生姜のありがたみを実感… pic.twitter.com/mtfFrrh0Dz   06:59:05
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  • RT @mikutaifuku : 行動データの計算論モデリング 強化学習モデルを例として shop.ohmsha.co.jp/shopdetail/000… まだ２章までしか読んでいないけど、かなり記述が丁寧でわかりやすく、内容も面白い。サポートページ（kkatahira.github.io/cmbd-book/inde… ）も充実しており、RやStanコードもGitHubに置かれている。素敵。   09:17:32
  • @chisatini さんの作図 "Cannibus Curve with ggplot2" の図を library(gridExtra) の grid.arrange() でならべてみました chichacha.netlify.com/2018/10/17/can… pic.twitter.com/I8cs221lPl   09:32:05
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  • Cannibus Curve with ggplot2 chichacha.netlify.com/2018/10/17/can… の作図を library(gridExtra) の grid.arrange() でならべてみました． pic.twitter.com/aNeH2d7ip0   09:48:27
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  • RT @TobakuCptlsm : タイトル見ただけでこいつは疑似因果（あえて疑似相関という単語を避けています）であって、交絡に実家の太さや家柄という答えが透けて見えてきた金曜日の朝はやる気がなかなか出てこない 子どもの時に、自宅に紙の本が何冊あったかが一生を左右する：ニューズウィーク日本版 www.newsweekjapan.jp/stories/world/…   10:49:20
  • まったく，どわすれしていたのだが… Linux なサーバの時計合わせは sudo /usr/sbin/ntpdate ntp.nict.jp …とかでしたね．   11:48:28
  • 今日も CentOS で，ひたすら時間の浪費をしていたのだが…いま気づいたんだけど /root/ になぜか Maildir があって，そこにメイルが蓄積されていた (29 MB)…これ，いったい何なんだろう？（ふう）   16:58:30
  • ここに dovecot の親切なる解説があるのだが… これをながめながら試行錯誤しても，なんだか配送がへんてこなことに… ちょっと危険な状況だな．不便をがまんして放置しているのだが． d.hatena.ne.jp/himenaotaro/20…   17:17:35

2018 年 10 月 20 日 (土)

• 0600 起床．
  • 樹木の成長解析の論文ながめてたら "ARSTAN" で推定した…なる記述があったので「え？何か Stan の応用？」と驚いてたら Cook ER (1985) A time series analysis approach to tree ring standardization …たぶん BASIC か Fortran で書いたソフトウェア？このぎょーかいでは，ありがちかも… pic.twitter.com/TjcZUnevxj   10:39:26
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  • 樹木の成長解析の最新論文ながめてたら "ARSTAN" で推定した…なる記述があったので「え？何か Stan の応用？」と驚いてたら Cook ER (1985) A time series analysis approach to tree ring standardization …たぶん BASIC か Fortran で書いたソフトウェア？このぎょーかいでは，ありがちかも… pic.twitter.com/6RULOzKLGT   10:46:26
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  • 1985 年において，すでに年輪（とか植物の長期観察データ）の解析は「直線あてはめとかではダメ」と気づいていたヒトたちがいるいっぽう…いまだに a + b x + c x^2 +…みたいなあてはめをやっているヒト，まだまだ，たくさんいますよ（え？ダメなの？と驚かれることが多い）たとえば 2015 年の論文． pic.twitter.com/1dOWWmHX8P   11:05:05
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  • …とはいえ，私も時系列データ解析で，いろいろ失敗ばかりしているので，今後もよく考えてモデリングしたいところ… pic.twitter.com/Y9jhVo9s4M   11:12:52
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  • ベータ分布で Beta(1, 1) は一様分布 (uniform distribution) pic.twitter.com/Yv0gFnNl5B   14:22:07
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  • RT @u_ribo : Tokyo.Rの初心者セッション、tidyverseゴリゴリ導入していって全体のレベルを上げようという試みは良いと思うけど、関数って何？パッケージって何？オブジェクト？ベクトル？？みたいな人には優しくない気がした。20分くらいの枠で話せる内容も限られるけど、難しいね。 #tokyor   14:59:59
  • RT @1009alice : 「いびつな政策の犠牲者」ベトナム人実習生らの相次ぐ死：朝日新聞デジタル www.asahi.com/articles/ASLBF… ７月１５日に自殺した２５歳の技能実習生の男性は、会社や日本に住む弟、ベトナムの家族に遺書を残していた。塗装関係の仕事をしていたが、「暴力やいじめがあってつらい」とつづられていた。   15:20:49
  • RT @u_ribo : 関数名の衝突問題を避けるのにconflictパッケージも良いですよー ref) uribo.hatenablog.com/entry/2018/09/… #tokyor   15:31:54