ぎょーむ日誌 2016-03-24

2016 年 03 月 24 日 (木)

• 0600 起床． 自分の仙台せとぎわぎょーむも終わったので， 今日はのんびり ……
  • RT @consaba : 【シノドス】魚は性を自由に換える／中村將 / 一般財団法人沖縄美ら島財団 synodos.jp/science/16506 #ss954 #synodos #radiko   07:25:21
  • 生態学会 #esj63 企画集会「生態学における因果推論：convergent cross mapping とその周辺」開始．"非線形な系では相関を見ても因果はわからない" "生態学のデータは短いものが多い…せいぜい100点" 30 点ぐらいの時系列に適用可能な CCM が登場．   09:36:59
  • #esj CCM 集会．まずは中山さん，CCM の原理．決定論的に力学系に由来する時系列な因果関係推定法．これと確率過程はどう区別するか？あとで説明．例による説明：二本の決定論的時系列 X, Y から X→Y という作用が定量できるか？推定ではなく類推という方法を使う．   09:43:04
  • #esj63 CCM 集会．類推は "似たパターン" をさがす…（久）これって一番似てる差分を探すのかな？時系列の次数も推定できるかな？…このあといろいろ説明がありそう…   09:45:35
  • #esj63 CCM 集会．似たパターンをどのように探すか？simplex projection．どういう次元に埋め込む？ターゲットとする点の近傍でも「点」がちらばるかどうか…相関係数で評価．うめこみ次元は最も良い未来予測ができる次元のもとで CCM ．相関係数 0.5 ぐらい？   09:50:42
  • #esj63 CCM．surrogation data を原因時系列とした CCM の結果を用いて，類推の正確性の決定．横軸：時系列長さ L，縦軸は相関で図示．L依存性が重要．サロゲイトデータ作る方法いろいろ…ツインサロゲイト法では因果関係なしが帰無仮説となる．   09:54:24
  • #esj63 CCM．Smap による非線形性チェック．非線形かどうかが重要．局所的線形予測法．非線形があるときは全データを使うのは良くない，局所予測が全体予測をうわまわっていれば非線形と判定．実データは確率過程も入る．小さなノイズにはロバスト．中山さんのハナシ，終了．   09:57:27
  • #esj63 CCM．この手法を仮説検定のように使えるのか？→使えるかも…など 4 件ほどの質疑応答．要旨は www.esj.ne.jp/meeting/abst/6… 次は阿部さん，CCM の応用例：動物の集団行動の解析．研究例と CCM コーディングの説明．   10:05:17
  • #esj CCM．応用例．宇宙線と気温，氷床コアにみるCO2と気温，サルの脳の神経電位．CCM で解析したいのは…実験ができない系，タイナミクスが重要な系（生態系の安定性，脳の機能など）．このあとは阿部さんの動物の集団行動の研究．局所的な個体間相互作用→集団行動の力学．   10:11:26
  • #esj63 CCM．いろいろな分野の研究者が動物集団行動に．総会さぼって撮影した水族館のサカナの秩序だった群れの行動．アリの行動軌跡の力学はぱっと見ただけでは不明．しかしアリ間の相互作用はあるはず．単独個体はカオス的，集団だと20分ぐらいの周期．エサとりに出る個体数はカオス．   10:14:49
  • #esj63 CCM トゲオオハリアリの研究．歩行軌跡．個体齢によって役割が異なる．二個体の歩行軌跡CCM→因果の一方向と双方向．因果なし個体ペアも．老アリ・若アリいろいろペア→若ペアどうし，夜より朝のほうが因果ありとなる場合が多い．5個体でやると特定個体間の関係をあらわすグラフ   10:21:21
  • #esj63 CCM．展望．自己組織化はリーダーなしが通説だが，アリ間の順位関係とかもありそう．網羅的に CCM で解析を行い，それから因果関係を調べる．このあとは CCM 実装の説明．Sugihara 論文は手法の理解と実装の困難さできちんと適用された例が少ない．   10:25:42
  • #esj63 CCM．質問 "欠測や不等間隔の時系列データに適用できるか" "網羅的に解析は実際には難しいのでは"→むずかしいかも？質問：網羅的にやったときの誤判定の制御は→これからの課題．”因果関係みつからなかった"→因果ナシを積極的にサポートできない（帰無仮説と同じ）．   10:32:04
  • #esj63 CCM．鈴木さん(NIES)，力学系理論から見たCCM：何ができて、何ができないのか？データの問題．1.CCMの計算に必要なデータ量が多い−アトラクターの堆積の増大．2.パラメーターの一貫性が保証されない．そもそもアトラクターとは？ある力学系の終着「点」．   10:37:45
  • #esj63 CCM に必要な点は埋め込み次元+1，多種の関係を扱う→アトラクターの体積増．パラメータの一貫性，現実にはパラメーター r が変化しないことは保証されない．変わると近傍点が集めにくくなったり，因果構造が変わったり．r がゆっくり変化してもレジームシフトがおこるかも．   10:41:10
  • #esj63 CCM のデータ量を少なくしたい．Simplex projectionでは近傍点の推移ベクトルの加重和．これに対して大域的な RBFN (radial basis function network)．SPより効率的に正確な予測が可能．SPは局所的で十分な近傍点が必要   10:48:17
  • #esj CCM と CMS の比較．CCM の 1/5 のデータで CMS は同じような結果．CMS は結合の強さ変化に頑健．CMS はノイズに弱いが，埋め込み次元を増やすことでカバーできる．複雑なネットワークでの CMS の有効性．9個のロジスティックマップをランダム結合．   10:53:30
  • #esj63 CCM と CMS (Cross Map Smoothness) の比較．CMS (RBFN) はデータ量が増えても予測は良くならない→ノイズに弱い．質疑応答．データが少ない時には CMS がよく多ければどちらでもよい．CMS の Rパッケージはない．   11:00:37
  • #esj63 CCM．CMS 論文 (1990 年前後) の共著者からの質問．機械学習における次元の呪い，CMS でも解決されてない？CMS は少ないデータのときに利点があるので，そもそも高次元にうめこめないので対処可．機械学習との関連．   11:05:39
  • #esj63 "CCMと移動エントロピーの比較"，山道さん．プランクトン実験系，迅速な進化と個体群動態．時系列のモデルベイス解析，マラリアと雨ふり．モデルがまちがっていたら？→モデルフリーな CCMなど．移動エントロピー（transfer entropy）とは…   11:16:26
  • #esj63 X, Y ふたつの時系列の相互情報量は因果性がないので時間をずらす．移動エントロピー T_{Y→X} (?)は"Yの過去の値を知っているとき，Xの値で未来のYの不確実性が減る量"．多変数版は直接効果を関節効果や共通の駆動要因と区別ができる…伊庭さん CCMへの疑問！   11:29:35
  • #esj63 CCM と移動平均 TE．環境 DNA とかで長い時系列データが得られれば TE の活躍の場が増えるかも．回答の難しい質疑応答．CCM だと季節性が強いときは特別な調整が必要，TE では？CCM と TE の「因果」は同じか？とくに隠れたZがある場合…   11:38:50
  • #esj "生態学における因果推論：convergent cross mapping とその周辺" ，終了．非線形な力学系の動態もでると観測データを対応づける方法が少しわかってきました．集会企画者のみなさんありがとうございます．私の実況 tweet がまちがってたらすみません…   11:49:45
  • 今日も #esj63 生態学会大会の仙台国際センター会議棟 1F の食堂で昼飯くったんだけど…昨日さがしまわって見つけられなかった電源，窓際のテーブルにあったのか．椅子が浅くこしかけるバーになっていてなかなか快適． pic.twitter.com/9ER04goYEK   12:16:55
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  • @a_symap おお，東京大会でも開催されますか．とても楽しみです．   12:23:39
  • ちょーしにのって #esj63 企画集会「生態学における因果推論：convergent cross mapping…」www.esj.ne.jp/meeting/abst/6… の"連つい"やったわけですが…ある種の迷惑行為かも…時間順に変更可→ twilog.org/KuboBook/date-…   12:28:49
  • @a_symap いや，とてもおもしろかったので，ついうっかり…ノイズ・エラーが多くて高次元な連ついストリームの中に埋め込まれているので，まあそういう情報は発見されない，のでは…と   12:31:32
  • . @berobero11 私のせとぎわ（本人がまったくのぞんでいない）研究発表準備せとぎわ決戦主義が前提になってますね…反論の余地は、まったくありませんが…あああ…   12:51:50
  • これからは tweet ボタン押す前に三回読みなおすことにしよう…   12:53:22
  • 生態学会 #esj63 ポスター発表会場…に来たのは何年ぶりだろう…ちょっとわくわく。 pic.twitter.com/gnHkocoUgv   13:03:06
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  • ポスター会場で樹木の枝の応力と光合成効率の関係とかアルゼンチンアリの樹木の好き嫌い…といった会話を楽しみ、地下鉄で広瀬川の上を渡って生態学会 #esj63 大会会場を去る…今は JR で仙台空港に移動中。 pic.twitter.com/jwsBKVlW90   15:22:23
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  • 笹かまぼこお買いものみっしょん…多様性に混乱ちゅう…かまさきはあるけどしらかまはない…？ pic.twitter.com/QDY5fZOiux   15:47:21
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  • かなり早めに空港にきたので岩波DS3ぎょーむでもやろうかな…と、うろうろ、閑散たる国際線ウイング横に電源みつけたので勝手に使っていたら警備員に注意されてしまった… pic.twitter.com/yhis0XHVFE   16:24:26
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  • 空腹なので早めの晩飯。仙台油麩（あぶらふ）丼と仙台空港の誘導路を移動する B777-200 （かな？） pic.twitter.com/P6wOLM1CJm   17:41:57
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  • この左右非対称な丼…箸を置きやすい、とゆー機能性の追及の帰結？なんとなく、食べやすい気はするんだけど…   17:49:10
  • @berobero11 ねるのが一番です。   18:37:39
  • 仙台空港。AIRDO B737-700、ウイングレット内側にクマのベアドゥが… pic.twitter.com/uJtGmf6kGm   18:44:02
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  • 内地から北辺の地に帰還しました。ベアドゥと月。 pic.twitter.com/CsrEzDU3tu   20:13:19
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  • RT @charinkoq : 相変わらずスーツ率少ない学会w RT @KuboBook : 生態学会 #esj63 ポスター発表会場…に来たのは何年ぶりだろう…ちょっとわくわく。 pic.twitter.com/CrsTkyT45H   20:21:39
  • RT @mitragyna : 【元素湯呑み】は寿司湯呑みパロディにありがちな架空漢字ではなく、「台湾における元素の漢字表記」を採用。 「らじうむ」もカッコいいけど、「たんたる」も可愛くて お気に入り。 pic.twitter.com/OIQde8GtfX   20:35:23
• 21 時すぎ， 帰宅 …… パジャマきてふとんに入ろうとしてた， 夜ふかしぼーいせんせいがびっくりしてました．
• その後， ただちに本よみとか ……