ぎょーむ日誌 2014-10-10

2014 年 10 月 10 日 (金)

• 0550 起床 …… いまいちよくねむれない． 朝飯・弁当の準備． 朝飯． コーヒー． 洗濯．
• 0825 自宅発． 雨． 0835 保育所着． 天気が悪くてもあひる組のみんなは朝から元気だ …… 0910 研究室着．
• 当方はばてぎみ ……
• 昼飯．
• 細胞生物学な問題を library(MCMCglmm) で片づけようとしたところ， 同 package の弱点が露呈したというか， 群差の variance がゼロに吸着してしまような問題が発生．
• しょうがないので， JAGS で何とかしようとする努力．
• その試行錯誤の過程でわかったことなのだが …… JAGS の並列化はあまり簡単でないかもしれない． WinBUGS の場合と同じで並列処理ごとに固有の乱数シードを設定する必要があるため． Manual をみると ".RNG.seed" といったグローバルな変数にいれるということで， これは並列化に対応していない ……
• 何やらこのあたりの並列化問題への対応が準備されているみたいなんだけど (parallel.seeds()?)， 本日はそのあたりを明確化できなかった ……
• 蛇足ながら， WinBUGS はこの問題は 比較的簡単に始末できる．
• JAGS については解決しないまま， 1720 研究室発． 買いもの． 保育所でとら回収． 1800 帰宅． 晩飯の準備． 晩飯．
• あいかわらず， とらは「夏まつり」気分がぬけてない …… しゃしゃんこしゃん♪
• とら風呂． とらねかしつけ． 洗濯．
• [今日の運動]
  • ラジオ体操: 0 回
• [今日の食卓]
  • 朝 (0610): 米 0.5 合． 野菜スープ．
  • 昼 (1200): 研究室． 米 0.7 合． 豆腐． 豚肉．
  • 晩 (1920): 米 0.7 合． 野菜スープ． ゴボウ・ニンジン・鶏肉の炒めもの．