ぎょーむ日誌 2012-01-31
2012 年 01 月 31 日 (火)
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0620 起床．
昨晩，
寝る前にやらせておいた計算は 4 時間ちょっとで終了していた．
並列化してなければ 9 時間ぐらいかかっただろうな．
まあ，
こんなところかなあ
(code)
……
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ラジオ体操．
弁当の準備．
朝飯．
コーヒー．
0750 自宅発．
晴．
0820 研究室着．
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とりあえず，
今朝えられた結果で最初の到達点までたどりついたことにしよう．
これらは保存しておいて，
次にもう少し説明変数をややこしくしたモデルで推定計算を
……
うーむ，
森・幹線道路・水域ぜんぶをいれると計算不能みたいだな．
森は除外するか．
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……
オチをさきに書いてしまうと，
このあたりの問題，じつは上のようにナマやさしいハナシではないということが，
最終的には夜中までかかってわかった
……
われながらまぬけすぎる．
まず「計算不能」うんぬんは事前分布の設定がまずすぎ．
二項分布の確率の事前分布を GLM 的なモデルとは少し異なる方式で
決めなければならなかったのだけど，
なぜかしらここでヘンな一様分布を使ってしまった．
WinBUGS が吐き出した error message に ``truncated beta distribution''
うんぬんと書かれているのにふと気づいて，
「どうして自分はベータ分布というものを完全に失念していたのだろう」
といぶかしみつつ修正したら，
エラーは出なくなり計算は高速化された．
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しかし，
問題はこれだけではない．
このアリデータは 9 年間もかけてとられたたいへんなものであるが，
それでもなお，
あれこれ推定するには情報が足りないのである．
「侵入的外来種」
となっているアルゼンチンありとて 9 年間という期間でみれば
「とてもゆっくり」と変化していくので，
そこから抽出可能な情報は限定される．
たとえば，
ありとあらゆる種類の「場所差」は推定できないかもしれない．
空間構造のあるデータであるにもかかわらず．
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1030 より研究室セミナー．
修論発表会直前対策
……
とかいうやつなんだけど
……
だいじょうぶかしらん?
まあ，
起学の修論発表会では「それは地球環境問題とどのような関係があるのですか?」
とゆー質問しかでないというウワサもあるけれど．
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昼飯．
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アリ苦闘．
雑用もときどきわりこむ．
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16 時ごろ，
生態学会さーばーのメイル関係の
/etc/initd
を再起動してみた
……
と記録しておく．
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さまざまな問題が解決しないまま，
1740 ぐったりと研究室発．
買いもの．
1810 帰宅．
晩飯の準備．
晩飯．
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真夜中までアリ問題にとりくむ
……
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[今日の運動]
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[今日の食卓]
- 朝 (0640):
米 0.5 合．
豆腐・ワカメの味噌汁．
コマツナ・モヤシ・ネギ・ナメコのゴマポン酢あえ．
- 昼 (1200):
研究室．
米 0.7 合．
レンコン・ニンジン・豚肉の炒めもの．
加賀揚げ．
ミニトマト．
レタス．
リンゴ．
- 晩 (1950):
米 0.5 合．
ダイコン・ニンジン・ナメコのスープ．
タマネギハンバーグ．
ジャガイモ・ブロッコリーの蒸しもの．
